15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_4187 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_4187  hypothetical protein  100 
 
 		 119 aa  241  3e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.429609 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3432  hypothetical protein  83.19 
 
 		 119 aa  209  1e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.275835  normal  0.581055 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1390  hypothetical protein  80.51 
 
 		 120 aa  194  5.000000000000001e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1176  hypothetical protein  66.12 
 
 		 125 aa  157  4e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1248  hypothetical protein  61.98 
 
 		 125 aa  141  3e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.625657  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0427  hypothetical protein  59.66 
 
 		 121 aa  134  5e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2361  hypothetical protein  68.33 
 
 		 119 aa  125  1.0000000000000001e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000000168319  unclonable  0.000000122129 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2402  hypothetical protein  50 
 
 		 122 aa  110  9e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2178  hypothetical protein  50 
 
 		 122 aa  108  3e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.207131  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1617  hypothetical protein  53.33 
 
 		 127 aa  99.4  1e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0691  hypothetical protein  50.83 
 
 		 123 aa  94  7e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.157339  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2867  hypothetical protein  52.94 
 
 		 119 aa  85.5  2e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.438274  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0940  hypothetical protein  43.37 
 
 		 124 aa  72.8  0.000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0739  hypothetical protein  53.75 
 
 		 221 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.355396  normal  0.7194 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0581  hypothetical protein  39.77 
 
 		 120 aa  60.1  0.00000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>