54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET1558 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002936  DET1558  reductive dehalogenase anchoring protein, putative  100 
 
 
90 aa  174  3e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0340749  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1537  reductive dehalogenase anchoring protein, putative  73.33 
 
 
90 aa  135  2e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.613741  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1544  reductive dehalogenase anchoring protein, putative  71.11 
 
 
90 aa  129  1.0000000000000001e-29  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1262  reductive dehalogenase anchoring protein  70 
 
 
90 aa  129  2.0000000000000002e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1401  reductive dehalogenase anchoring protein  68.89 
 
 
90 aa  126  9.000000000000001e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000581103  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1435  reductive dehalogenase anchoring protein  68.54 
 
 
90 aa  113  8.999999999999998e-25  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1352  reductive dehalogenase anchoring protein  58.89 
 
 
90 aa  112  2.0000000000000002e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1429  reductive dehalogenase anchoring protein  74.44 
 
 
90 aa  112  2.0000000000000002e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_98  reductive dehalogenase anchoring protein  55.56 
 
 
91 aa  106  1e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1326  reductive dehalogenase anchoring protein  54.44 
 
 
93 aa  101  4e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0175  reductive dehalogenase anchoring protein, putative  74.44 
 
 
90 aa  100  8e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0303  reductive dehalogenase anchoring protein, putative  63.51 
 
 
90 aa  99.8  1e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0120  hypothetical protein  63.01 
 
 
90 aa  97.4  6e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1341  reductive dehalogenase anchoring protein  61.11 
 
 
90 aa  97.1  8e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1343  reductive dehalogenase anchoring protein  61.11 
 
 
90 aa  97.1  8e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0282  hypothetical protein  61.11 
 
 
91 aa  95.1  3e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0297  hypothetical protein  60 
 
 
76 aa  95.1  3e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00163129  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_103  reductive dehalogenase anchoring protein  60 
 
 
90 aa  94.4  5e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0875  reductive dehalogenase anchoring protein, putative  58.89 
 
 
90 aa  93.6  7e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.328345  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0277  hypothetical protein  59.55 
 
 
90 aa  92.8  1e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1313  reductive dehalogenase anchoring protein  65.56 
 
 
93 aa  89  2e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_87  reductive dehalogenase anchoring protein  55.17 
 
 
91 aa  87.4  6e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1420  reductive dehalogenase anchoring protein  63.74 
 
 
90 aa  86.3  1e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0287032  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0103  hypothetical protein  44.94 
 
 
98 aa  84.3  5e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.16047  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0312  reductive dehalogenase anchoring protein, putative  47.25 
 
 
98 aa  79.7  0.00000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1374  reductive dehalogenase anchoring protein  46.59 
 
 
95 aa  77.8  0.00000000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1518  reductive dehalogenase anchoring protein, putative  46.59 
 
 
95 aa  75.9  0.0000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.217983  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1363  reductive dehalogenase anchoring protein  44.68 
 
 
95 aa  73.6  0.0000000000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1370  reductive dehalogenase anchoring protein  45.35 
 
 
93 aa  71.2  0.000000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_81  reductive dehalogenase anchoring protein  42.39 
 
 
99 aa  70.5  0.000000000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0236  reductive dehalogenase anchoring protein, putative  51.19 
 
 
92 aa  68.9  0.00000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1339  reductive dehalogenase anchoring protein  52.86 
 
 
106 aa  65.5  0.0000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1323  reductive dehalogenase anchoring protein  43.33 
 
 
90 aa  61.2  0.000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.208232  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0111  hypothetical protein  37.5 
 
 
89 aa  61.2  0.000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1527  reductive dehalogenase anchoring protein, putative  39.73 
 
 
95 aa  59.3  0.00000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1319  reductive dehalogenase anchoring protein  44.09 
 
 
95 aa  58.9  0.00000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1259  reductive dehalogenase anchoring protein  41.57 
 
 
89 aa  58.9  0.00000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1426  reductive dehalogenase anchoring protein  41.57 
 
 
89 aa  58.9  0.00000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00712862  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1307  reductive dehalogenase anchoring protein  38.89 
 
 
89 aa  58.2  0.00000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0319  reductive dehalogenase anchoring protein, putative  46.15 
 
 
89 aa  53.9  0.0000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.045097  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1377  reductive dehalogenase anchoring protein  38.2 
 
 
89 aa  52.4  0.000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1334  reductive dehalogenase anchoring protein  86.67 
 
 
33 aa  51.2  0.000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0127  hypothetical protein  54.55 
 
 
113 aa  51.2  0.000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.553071  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1315  reductive dehalogenase anchoring protein  42.05 
 
 
89 aa  50.4  0.000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1398  reductive dehalogenase anchoring protein  42.05 
 
 
89 aa  50.4  0.000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0508329  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1382  reductive dehalogenase anchoring protein  44.83 
 
 
95 aa  49.7  0.00001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1534  reductive dehalogenase anchoring protein, putative  44.12 
 
 
89 aa  48.5  0.00003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000305425  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2099  reductive dehalogenase anchoring protein, putative  34.57 
 
 
93 aa  46.6  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1392  reductive dehalogenase anchoring protein  47.06 
 
 
89 aa  45.8  0.0002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000655295  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_203  hypothetical protein  56.82 
 
 
114 aa  45.1  0.0003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1521  reductive dehalogenase anchoring protein, putative  37.08 
 
 
89 aa  44.3  0.0006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.220887  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0307  reductive dehalogenase anchoring protein, putative  39.24 
 
 
91 aa  44.3  0.0006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.147149  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1730  hypothetical protein  32.1 
 
 
91 aa  43.5  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000103931 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0283  hypothetical protein  35.56 
 
 
88 aa  41.6  0.003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>