62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_3250 on replicon NC_013161
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_3250  photosystem II S4 domain protein  100 
 
 		 259 aa  516  1.0000000000000001e-145  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2846  photosystem II S4 domain protein  100 
 
 		 259 aa  516  1.0000000000000001e-145  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4774  photosystem II S4 domain protein  79.07 
 
 		 259 aa  430  1e-119  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.789019 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1012  RNA-binding S4  71.71 
 
 		 259 aa  395  1e-109  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00865709 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5081  photosystem II S4 domain-containing protein  71.32 
 
 		 259 aa  388  1e-107  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.673535  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2321  photosystem II S4 domain protein  69.77 
 
 		 259 aa  377  1e-104  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4198  RNA-binding S4  68.22 
 
 		 259 aa  377  1e-104  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113928  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1503  RNA-binding S4  65.12 
 
 		 259 aa  357  9e-98  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.2704  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41009  predicted protein  46.22 
 
 		 303 aa  232  5e-60  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.106009  normal  0.55194 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2152  RNA-binding S4  41.7 
 
 		 258 aa  185  7e-46  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.224826  normal  0.370435 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1454  RNA-binding S4  35.5 
 
 		 263 aa  174  9.999999999999999e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0928  RNA-binding S4  39.08 
 
 		 262 aa  173  2.9999999999999996e-42  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.618898  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05221  S4-like domain-containing protein  35.23 
 
 		 295 aa  172  3.9999999999999995e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17841  S4-like domain-containing protein  37.93 
 
 		 262 aa  172  3.9999999999999995e-42  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.348814  normal  0.852292 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15571  S4-like domain-containing protein  34.73 
 
 		 263 aa  172  5e-42  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15171  S4-like domain-containing protein  35.5 
 
 		 263 aa  171  1e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1086  RNA-binding S4 domain protein  39.69 
 
 		 267 aa  171  1e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000000637661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15421  S4-like domain-containing protein  34.35 
 
 		 263 aa  170  2e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0340616  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14111  hypothetical protein  38.82 
 
 		 262 aa  169  3e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.531857  normal  0.068656 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09250  RNA-binding S4 domain protein  37.02 
 
 		 262 aa  166  5e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0028436  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0715  RNA-binding S4 domain-containing protein  36.51 
 
 		 255 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.369549  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1318  RNA-binding S4 domain protein  34.27 
 
 		 265 aa  163  3e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.210837  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0525  RNA-binding S4  37.07 
 
 		 261 aa  157  2e-37  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0789  RNA-binding S4  36.98 
 
 		 263 aa  149  6e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000446217  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0599  RNA-binding S4 domain protein  33.46 
 
 		 260 aa  139  6e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000013354  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1889  RNA-binding S4 domain-containing protein  36.72 
 
 		 248 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000373186  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1347  RNA-binding S4 domain protein  34.51 
 
 		 260 aa  131  1.0000000000000001e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000348222  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1037  RNA-binding S4 domain protein  29.39 
 
 		 257 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000298489  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2106  S4 domain-containing protein  30.38 
 
 		 253 aa  110  3e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00816123  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1820  S4 domain-containing protein  30 
 
 		 253 aa  108  1e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000243371  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1243  S4 domain protein  31.7 
 
 		 255 aa  103  3e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000893019  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3724  RNA-binding S4 domain-containing protein  30.7 
 
 		 255 aa  103  3e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0195579  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1907  RNA-binding S4 domain protein  28.63 
 
 		 257 aa  102  4e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3998  S4 domain protein  31.7 
 
 		 241 aa  103  4e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000894164  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0596  RNA-binding S4 domain-containing protein  30.8 
 
 		 261 aa  102  5e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000430784  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2546  RNA-binding S4 domain-containing protein  31.42 
 
 		 257 aa  102  5e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0803565  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0483  ylmH protein  28.51 
 
 		 262 aa  102  6e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3942  S4 domain-containing protein  31 
 
 		 255 aa  100  3e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.131052  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3949  S4 domain protein  31.25 
 
 		 255 aa  100  3e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000108737  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2360  RNA-binding S4 domain-containing protein  29.96 
 
 		 263 aa  99.8  4e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000894269  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3639  S4 domain-containing protein  32.02 
 
 		 255 aa  99.4  5e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000680133  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4036  s4 domain-containing protein  32.02 
 
 		 255 aa  99.4  6e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00128697  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3748  S4 domain-containing protein  32.02 
 
 		 255 aa  99.4  6e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.125171  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3656  S4 domain-containing protein  31.76 
 
 		 255 aa  99.4  6e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3911  S4 domain protein  30.8 
 
 		 255 aa  98.6  9e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000445845 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1198  cell division protein  27.56 
 
 		 265 aa  97.4  2e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4044  RNA-binding S4 domain protein  30.77 
 
 		 265 aa  95.9  6e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000223229  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1489  cell division protein  27.11 
 
 		 265 aa  93.2  3e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1087  RNA-binding S4 domain protein  37.32 
 
 		 255 aa  83.6  0.000000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1264  RNA-binding S4 domain protein  26.64 
 
 		 245 aa  81.6  0.00000000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0953  RNA-binding S4 domain protein  28.57 
 
 		 259 aa  80.5  0.00000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2058  cell division protein  26.72 
 
 		 263 aa  80.1  0.00000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0920  RNA-binding S4 domain protein  25.29 
 
 		 255 aa  78.6  0.0000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000818747  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1250  RNA-binding S4 domain-containing protein  25.93 
 
 		 268 aa  77.8  0.0000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000129333  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1275  RNA-binding S4 domain-containing protein  25.93 
 
 		 268 aa  77.8  0.0000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000253973  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0781  cell division protein  23.08 
 
 		 266 aa  76.6  0.0000000000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0824201  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1140  cell division protein  27.55 
 
 		 256 aa  73.6  0.000000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0756  ylmH protein  26.67 
 
 		 220 aa  67.8  0.0000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.031626  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1296  hypothetical protein  27.57 
 
 		 255 aa  67.4  0.0000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0877  RNA-binding S4 domain protein  27.47 
 
 		 231 aa  56.2  0.0000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.702037 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2020  RNA-binding S4  27.45 
 
 		 262 aa  52.4  0.000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2761  RNA-binding S4 domain-containing protein  27.09 
 
 		 227 aa  50.1  0.00004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>