13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_3144 on replicon NC_013161
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011721  PCC8801_4497  transposase IS4 family protein  99.03 
 
 
1020 bp  787    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3382  transposase IS4 family protein  99.76 
 
 
1020 bp  811    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3846  transposase IS4 family protein  99.76 
 
 
1020 bp  811    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2795    100 
 
 
701 bp  706    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.276247 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3144    100 
 
 
719 bp  1425    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00923017  normal  0.546163 
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4477    99.68 
 
 
1061 bp  603  1e-170  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3633  transposase IS4 family protein  90.77 
 
 
1020 bp  502  1e-140  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1817    99.47 
 
 
219 bp  365  1e-98  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0158    92.31 
 
 
525 bp  71.9  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0160  putative transposase  92.31 
 
 
231 bp  71.9  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0261  transposase IS4  92.68 
 
 
1023 bp  58  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3153  transposase IS4  92.68 
 
 
1023 bp  58  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0912286  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0157    93.75 
 
 
513 bp  48.1  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>