13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_R0012 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_R0012    100 
 
 
384 bp  761    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.532741  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0048    94.59 
 
 
395 bp  58  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0052    91.11 
 
 
390 bp  58  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.208079 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0039    82.95 
 
 
387 bp  56  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.88974 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0051    82.93 
 
 
387 bp  52  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0019    96.55 
 
 
371 bp  50.1  0.0005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00441187  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0017    93.55 
 
 
391 bp  46.1  0.007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00271537  normal  0.043691 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0035  tRNA-Asp  100 
 
 
77 bp  46.1  0.007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000000822611  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0043  tRNA-Asp  100 
 
 
77 bp  46.1  0.007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000153276  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0091  tRNA-Asp  100 
 
 
77 bp  46.1  0.007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000179456  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0072    93.55 
 
 
336 bp  46.1  0.007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00542398  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0054  tRNA-Asp  100 
 
 
77 bp  46.1  0.007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000217975  normal  0.910624 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0087  tRNA-Asp  100 
 
 
77 bp  46.1  0.007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>