52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_2863 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_2863  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
525 aa  1071    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0105182  normal  0.334378 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2335  Tetratricopeptide domain protein  51.35 
 
 
563 aa  503  1e-141  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0014328 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2694  TPR repeat-containing protein  52.38 
 
 
580 aa  497  1e-139  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.407623  normal  0.0520639 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3429  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  45.98 
 
 
572 aa  459  9.999999999999999e-129  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2675  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  45.58 
 
 
572 aa  454  1.0000000000000001e-126  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20870  Tetratricopeptide repeat (TPR) protein  44.88 
 
 
539 aa  413  1e-114  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0555  tetratricopeptide region  42 
 
 
560 aa  405  1.0000000000000001e-112  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.45789  normal  0.384774 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1851  TPR repeat-containing protein  41.7 
 
 
571 aa  396  1e-109  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4467  Tetratricopeptide repeat protein  41.98 
 
 
568 aa  392  1e-108  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.412623  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1581  Tetratricopeptide domain protein  43.86 
 
 
578 aa  388  1e-106  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00337533  normal  0.487012 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2264  hypothetical protein  41.19 
 
 
621 aa  368  1e-100  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.750308  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2869  hypothetical protein  41.21 
 
 
568 aa  361  2e-98  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.451672  normal  0.628109 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1877  hypothetical protein  41.42 
 
 
587 aa  351  2e-95  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.220347  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1371  TPR repeat-containing protein  40.8 
 
 
601 aa  348  1e-94  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0432859  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0768  TPR repeat-containing protein  38.81 
 
 
552 aa  334  2e-90  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.400083 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1969  hypothetical protein  39.83 
 
 
581 aa  316  8e-85  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2307  TPR repeat-containing protein  37.14 
 
 
598 aa  283  8.000000000000001e-75  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.062343 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3291  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.29 
 
 
625 aa  281  3e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1486  TPR repeat-containing protein  37.27 
 
 
623 aa  274  4.0000000000000004e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1004  TPR repeat-containing protein  35.11 
 
 
625 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1317  TPR repeat-containing protein  37.37 
 
 
533 aa  268  2e-70  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.573669  normal  0.99771 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4301  TPR repeat-containing protein  35.89 
 
 
625 aa  264  3e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03987  TPR domain protein (AFU_orthologue; AFUA_3G00240)  34.65 
 
 
580 aa  262  1e-68  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02878  conserved hypothetical protein  35.45 
 
 
594 aa  262  1e-68  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.291051 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2796  TPR repeat-containing protein  34.39 
 
 
563 aa  254  3e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.489638  normal  0.742166 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2769  tetratricopeptide TPR_2  34.39 
 
 
563 aa  254  3e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.156917  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2813  TPR repeat-containing protein  34.39 
 
 
563 aa  254  3e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.48594  normal  0.196641 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1465  TPR repeat-containing protein  35.57 
 
 
574 aa  254  3e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.388393  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2608  TPR domain-containing protein  35.57 
 
 
601 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1379  TPR repeat-containing protein  35.57 
 
 
559 aa  253  7e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3331  TPR repeat-containing protein  34.29 
 
 
565 aa  250  3e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.643296  normal  0.0437808 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0989  hypothetical protein  33.54 
 
 
577 aa  246  4.9999999999999997e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.659659  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3057  TPR repeat-containing protein  35.86 
 
 
559 aa  244  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.297776 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3942  TPR repeat-containing protein  34.01 
 
 
563 aa  243  5e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.171262  normal  0.567153 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0462  TPR domain-containing protein  33.6 
 
 
537 aa  234  4.0000000000000004e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0186  TPR domain-containing protein  33.6 
 
 
537 aa  234  4.0000000000000004e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.240778  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1113  TPR repeat-containing protein  33.6 
 
 
537 aa  234  4.0000000000000004e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0490058  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0381  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.19 
 
 
559 aa  233  4.0000000000000004e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.850569  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1219  TPR domain-containing protein  33.6 
 
 
537 aa  234  4.0000000000000004e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.121944  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4326  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.08 
 
 
584 aa  231  2e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006680  CNK03470  conserved expressed protein  32.81 
 
 
576 aa  228  2e-58  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0846142  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02657  conserved hypothetical protein  32.03 
 
 
600 aa  216  5.9999999999999996e-55  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.0000025246  normal  0.0917143 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_38668  predicted protein  32.08 
 
 
626 aa  188  2e-46  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0793283  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1942  tetratricopeptide TPR_4  28.06 
 
 
530 aa  133  6e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5657  tetratricopeptide TPR_4  27.02 
 
 
530 aa  130  7.000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2242  TPR repeat-containing protein  26.91 
 
 
541 aa  129  1.0000000000000001e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.433133  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3941  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.25 
 
 
871 aa  120  7.999999999999999e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.817968  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3655  TPR repeat-containing protein  24.34 
 
 
506 aa  112  2.0000000000000002e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.822576  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1061  tetratricopeptide domain-containing protein  25.83 
 
 
556 aa  97.4  6e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2073  TPR repeat-containing protein  23.14 
 
 
532 aa  77.4  0.0000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.378967 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1186  TPR repeat-containing protein  34.01 
 
 
1197 aa  47  0.0009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2168  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.17 
 
 
537 aa  43.5  0.01  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>