23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_R0004 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_R0004  tRNA-Glu  100 
 
 
75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.926087 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0044  tRNA-Glu  87.69 
 
 
75 bp  65.9  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000299707  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0010  tRNA-Glu  94.44 
 
 
75 bp  56  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0085  tRNA-Glu  94.44 
 
 
75 bp  56  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.015611  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0082  tRNA-Glu  92.31 
 
 
72 bp  54  0.000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0019  tRNA-Glu  92.31 
 
 
75 bp  54  0.000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000000450697  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppt27  tRNA-Glu  89.74 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1242  tRNA-Glu  83.1 
 
 
75 bp  46.1  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0541834  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0055  tRNA-Glu  89.74 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.380229  normal  0.600027 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0045  tRNA-Glu  89.74 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.0000328054  normal  0.0346347 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0053  tRNA-Glu  89.74 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.646689  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0043  tRNA-Glu  89.74 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  unclonable  7.66398e-18  hitchhiker  0.000611065 
 
 
-
 
NC_006369  lplt27  tRNA-Glu  89.74 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt26  tRNA-Glu  89.74 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppt26  tRNA-Glu  89.74 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0573  tRNA-Glu  86 
 
 
75 bp  44.1  0.004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2944  tRNA-Glu  86 
 
 
75 bp  44.1  0.004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.251597  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2947  tRNA-Glu  86 
 
 
75 bp  44.1  0.004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.275452  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2950  tRNA-Glu  86 
 
 
75 bp  44.1  0.004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0349491  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0559  tRNA-Glu  86 
 
 
75 bp  44.1  0.004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2627  tRNA-Glu  86 
 
 
75 bp  44.1  0.004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2630  tRNA-Glu  86 
 
 
75 bp  44.1  0.004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.842478  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2633  tRNA-Glu  86 
 
 
75 bp  44.1  0.004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.449079  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>