62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0789 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_0789  RNA-binding S4  100 
 
 		 263 aa  533  1e-151  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000446217  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0599  RNA-binding S4 domain protein  47.55 
 
 		 260 aa  235  4e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000013354  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0715  RNA-binding S4 domain-containing protein  40.78 
 
 		 255 aa  186  3e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.369549  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09250  RNA-binding S4 domain protein  39.25 
 
 		 262 aa  182  4.0000000000000006e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0028436  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1086  RNA-binding S4 domain protein  37.88 
 
 		 267 aa  181  1e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000000637661  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1318  RNA-binding S4 domain protein  37.88 
 
 		 265 aa  176  3e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.210837  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1889  RNA-binding S4 domain-containing protein  41.7 
 
 		 248 aa  168  6e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000373186  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1347  RNA-binding S4 domain protein  43.48 
 
 		 260 aa  164  1.0000000000000001e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000348222  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4198  RNA-binding S4  38.1 
 
 		 259 aa  157  2e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113928  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1012  RNA-binding S4  35.85 
 
 		 259 aa  154  1e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00865709 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1503  RNA-binding S4  34.87 
 
 		 259 aa  153  2e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.2704  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5081  photosystem II S4 domain-containing protein  34.94 
 
 		 259 aa  148  7e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.673535  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2846  photosystem II S4 domain protein  36.98 
 
 		 259 aa  149  7e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2321  photosystem II S4 domain protein  35.32 
 
 		 259 aa  148  7e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3250  photosystem II S4 domain protein  36.98 
 
 		 259 aa  149  7e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4774  photosystem II S4 domain protein  34.2 
 
 		 259 aa  144  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.789019 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3911  S4 domain protein  38.29 
 
 		 255 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000445845 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2546  RNA-binding S4 domain-containing protein  34.27 
 
 		 257 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0803565  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3942  S4 domain-containing protein  37.39 
 
 		 255 aa  132  5e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.131052  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3639  S4 domain-containing protein  37.84 
 
 		 255 aa  132  6e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000680133  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3656  S4 domain-containing protein  37.84 
 
 		 255 aa  132  7.999999999999999e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3949  S4 domain protein  37.39 
 
 		 255 aa  131  9e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000108737  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3724  RNA-binding S4 domain-containing protein  37.95 
 
 		 255 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0195579  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1037  RNA-binding S4 domain protein  31.62 
 
 		 257 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000298489  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4036  s4 domain-containing protein  37.84 
 
 		 255 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00128697  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3748  S4 domain-containing protein  37.84 
 
 		 255 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.125171  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3998  S4 domain protein  36.49 
 
 		 241 aa  129  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000894164  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1243  S4 domain protein  36.04 
 
 		 255 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000893019  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41009  predicted protein  33.09 
 
 		 303 aa  126  5e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.106009  normal  0.55194 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2360  RNA-binding S4 domain-containing protein  33.48 
 
 		 263 aa  123  2e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000894269  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0920  RNA-binding S4 domain protein  34.38 
 
 		 255 aa  122  5e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000818747  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1907  RNA-binding S4 domain protein  31.69 
 
 		 257 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0596  RNA-binding S4 domain-containing protein  32.74 
 
 		 261 aa  113  3e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000430784  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4044  RNA-binding S4 domain protein  34.27 
 
 		 265 aa  106  4e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000223229  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2106  S4 domain-containing protein  33.33 
 
 		 253 aa  105  7e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00816123  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1820  S4 domain-containing protein  32.84 
 
 		 253 aa  103  2e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000243371  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1250  RNA-binding S4 domain-containing protein  31.05 
 
 		 268 aa  102  6e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000129333  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1275  RNA-binding S4 domain-containing protein  31.05 
 
 		 268 aa  102  6e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000253973  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0483  ylmH protein  30.64 
 
 		 262 aa  101  1e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1489  cell division protein  32.29 
 
 		 265 aa  101  1e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0756  ylmH protein  33.33 
 
 		 220 aa  100  2e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.031626  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1264  RNA-binding S4 domain protein  28.03 
 
 		 245 aa  99  7e-20  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1087  RNA-binding S4 domain protein  34.48 
 
 		 255 aa  91.3  1e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1198  cell division protein  30.09 
 
 		 265 aa  89.4  5e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1296  hypothetical protein  32.24 
 
 		 255 aa  81.3  0.00000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17841  S4-like domain-containing protein  32.2 
 
 		 262 aa  80.9  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.348814  normal  0.852292 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1140  cell division protein  27.2 
 
 		 256 aa  79.7  0.00000000000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2020  RNA-binding S4  28.89 
 
 		 262 aa  78.2  0.0000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0928  RNA-binding S4  31.22 
 
 		 262 aa  75.9  0.0000000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.618898  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14111  hypothetical protein  26.54 
 
 		 262 aa  73.9  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.531857  normal  0.068656 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1454  RNA-binding S4  28.4 
 
 		 263 aa  71.6  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15421  S4-like domain-containing protein  29.27 
 
 		 263 aa  69.7  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0340616  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0781  cell division protein  25.43 
 
 		 266 aa  69.3  0.00000000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0824201  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0877  RNA-binding S4 domain protein  28.81 
 
 		 231 aa  69.3  0.00000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.702037 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2058  cell division protein  24.19 
 
 		 263 aa  67.4  0.0000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15571  S4-like domain-containing protein  29.27 
 
 		 263 aa  66.2  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0525  RNA-binding S4  26.81 
 
 		 261 aa  65.9  0.0000000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2152  RNA-binding S4  25.5 
 
 		 258 aa  62.4  0.000000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.224826  normal  0.370435 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05221  S4-like domain-containing protein  24.09 
 
 		 295 aa  61.6  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2761  RNA-binding S4 domain-containing protein  26.61 
 
 		 227 aa  58.2  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0953  RNA-binding S4 domain protein  23.65 
 
 		 259 aa  57  0.0000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15171  S4-like domain-containing protein  29.3 
 
 		 263 aa  56.2  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>