10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0739 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_0739  hypothetical protein  100 
 
 		 574 aa  1160    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0166259  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2463  Pyrrolo-quinoline quinone  51.8 
 
 		 604 aa  490  1e-137  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2464  Pyrrolo-quinoline quinone  44.37 
 
 		 605 aa  487  1e-136  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2086  Pyrrolo-quinoline quinone  41.68 
 
 		 568 aa  377  1e-103  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2085  Pyrrolo-quinoline quinone  40.78 
 
 		 569 aa  369  1e-100  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3457  Pyrrolo-quinoline quinone  38.54 
 
 		 585 aa  335  2e-90  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000191045  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2088  hypothetical protein  50 
 
 		 73 aa  52  0.00003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1863  Pyrrolo-quinoline quinone  26.87 
 
 		 462 aa  48.9  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3290  serine/threonine protein kinase  27.89 
 
 		 963 aa  43.9  0.009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0556916 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0262  Pyrrolo-quinoline quinone  24.76 
 
 		 407 aa  43.5  0.009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>