19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_2394 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_2394  hypothetical protein  100 
 
 
376 aa  752    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0067  hypothetical protein  46.61 
 
 
397 aa  297  2e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0120  hypothetical protein  45.35 
 
 
395 aa  293  3e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72300  hypothetical protein  48.24 
 
 
346 aa  291  1e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5084  hypothetical protein  47.42 
 
 
340 aa  288  1e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0424557 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0159  hypothetical protein  48.02 
 
 
340 aa  288  1e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.860597 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6275  hypothetical protein  47.6 
 
 
340 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0161  hypothetical protein  47.15 
 
 
341 aa  286  5e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.853384  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0143  hypothetical protein  47.15 
 
 
341 aa  285  7e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.109428  normal  0.11094 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2156  hypothetical protein  47.94 
 
 
341 aa  283  5.000000000000001e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00627834  normal  0.0979823 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01770  hypothetical protein  48.04 
 
 
337 aa  282  6.000000000000001e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0036  hypothetical protein  43.36 
 
 
342 aa  268  8.999999999999999e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.326703  normal  0.177153 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3543  hypothetical protein  45.2 
 
 
365 aa  222  9.999999999999999e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.571666  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2318  hypothetical protein  36.71 
 
 
130 aa  57  0.0000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000668387  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0714  hypothetical protein  34.83 
 
 
369 aa  53.5  0.000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1796  hypothetical protein  30.11 
 
 
137 aa  52  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00914712  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0953  hypothetical protein  32.1 
 
 
114 aa  50.1  0.00006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2048  hypothetical protein  28.26 
 
 
133 aa  45.1  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000179688  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2488  hypothetical protein  30.09 
 
 
131 aa  44.3  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.694196  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>