16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3309 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_3309  protein of unknown function DUF1634  100 
 
 		 132 aa  261  2e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.339425  hitchhiker  0.000416312 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0601  protein of unknown function DUF1634  42.98 
 
 		 131 aa  104  5e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3911  hypothetical protein  42.74 
 
 		 124 aa  90.5  7e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000126391  normal  0.0429532 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3138  protein of unknown function DUF1634  38.26 
 
 		 119 aa  70.1  0.00000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3786  hypothetical protein  33.61 
 
 		 184 aa  68.6  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.173213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3318  hypothetical protein  33.33 
 
 		 135 aa  67.4  0.00000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0944  hypothetical protein  36.44 
 
 		 130 aa  65.9  0.0000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2524  hypothetical protein  34.11 
 
 		 125 aa  64.7  0.0000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0192345  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3868  protein of unknown function DUF1634  33.61 
 
 		 121 aa  61.6  0.000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0290618  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1844  hypothetical protein  30.08 
 
 		 124 aa  54.3  0.0000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0548  hypothetical protein  40.28 
 
 		 127 aa  53.9  0.0000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.835755  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0998  protein of unknown function DUF1634  36.44 
 
 		 127 aa  50.4  0.000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1252  hypothetical protein  33.93 
 
 		 127 aa  44.7  0.0004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0230297  normal  0.616342 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1909  hypothetical protein  37.5 
 
 		 122 aa  43.1  0.001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.110059  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1650  protein of unknown function DUF1634  33.33 
 
 		 118 aa  43.5  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.12179  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1183  hypothetical protein  32.14 
 
 		 119 aa  41.2  0.005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.529449 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>