21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2209 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_2209  DinB family protein  100 
 
 
166 aa  337  4e-92  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00119312 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1276  DinB family protein  38.55 
 
 
166 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4655  hypothetical protein  30.86 
 
 
167 aa  92.4  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3228  hypothetical protein  30.25 
 
 
167 aa  93.2  2e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4640  hypothetical protein  31.48 
 
 
167 aa  92.4  3e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4276  hypothetical protein  30.86 
 
 
167 aa  91.3  6e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.235759  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4266  hypothetical protein  30.86 
 
 
167 aa  90.5  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4643  hypothetical protein  30.86 
 
 
167 aa  90.5  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0596  hypothetical protein  30.86 
 
 
167 aa  90.1  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4656  hypothetical protein  30.25 
 
 
167 aa  89.7  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4358  DinB family protein  29.63 
 
 
167 aa  88.2  5e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4426  hypothetical protein  29.63 
 
 
167 aa  87.8  7e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4768  hypothetical protein  29.63 
 
 
167 aa  87.8  7e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.400929  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2312  DinB  28.39 
 
 
166 aa  60.5  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.223242 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3853  hypothetical protein  27.22 
 
 
165 aa  55.8  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0681  hypothetical protein  23.12 
 
 
165 aa  53.1  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.340859  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4547  DinB  23.03 
 
 
172 aa  48.5  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.521013  normal  0.113984 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7171  DinB family protein  22.44 
 
 
170 aa  44.7  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000400672  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0081  DinB  27.95 
 
 
164 aa  44.3  0.0007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1959  DinB family protein  38.3 
 
 
166 aa  41.6  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.178951 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1083  DinB  26.09 
 
 
173 aa  41.2  0.007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.437531  normal  0.0391417 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>