29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_0708 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_0708  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  100 
 
 
385 aa  801    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0263  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  37.08 
 
 
393 aa  276  4e-73  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1852  hypothetical protein  35.51 
 
 
383 aa  253  4.0000000000000004e-66  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3062  formiminoglutamase-related protein  35.59 
 
 
409 aa  244  1.9999999999999999e-63  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.511055 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00720  hypothetical protein  31.51 
 
 
388 aa  224  3e-57  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.487069  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1744  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  32.37 
 
 
372 aa  186  7e-46  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.311392  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1596  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  23.4 
 
 
316 aa  72.4  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3735  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  26.46 
 
 
316 aa  69.3  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.498261  normal  0.103946 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0232  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  28.47 
 
 
328 aa  68.2  0.0000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2359  formimidoylglutamase  26.12 
 
 
311 aa  56.6  0.0000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2402  formimidoylglutamase  26.12 
 
 
311 aa  56.6  0.0000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003721  formiminoglutamase  23 
 
 
336 aa  55.1  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0925  putative agmatinase  31.82 
 
 
291 aa  52.4  0.00001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0824  formimidoylglutamase  21.45 
 
 
336 aa  51.2  0.00003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000103972  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1919  formimidoylglutamase  25 
 
 
311 aa  50.4  0.00005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1543  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  23.19 
 
 
305 aa  47.8  0.0003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0983244  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03170  formiminoglutamase  23.38 
 
 
317 aa  47.4  0.0005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0694  agmatinase  33.08 
 
 
291 aa  47.4  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.464925  normal  0.230846 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23170  formimidoylglutamase  23.33 
 
 
311 aa  46.6  0.0007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000566858 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02330  formimidoylglutamase  23.81 
 
 
348 aa  46.2  0.001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1896  agmatinase  29.81 
 
 
289 aa  45.8  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.436435  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02074  formimidoylglutamase  20.34 
 
 
345 aa  45.4  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2336  agmatinase  34.91 
 
 
287 aa  45.1  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.329379 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1954  formimidoylglutamase  23.38 
 
 
311 aa  45.1  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0479136  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1085  agmatinase  29.92 
 
 
282 aa  43.1  0.008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0599  formimidoylglutamase  22.34 
 
 
325 aa  43.1  0.008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00699527 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0832  putative agmatinase  29.92 
 
 
282 aa  43.1  0.008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1824  agmatinase  32.06 
 
 
282 aa  43.1  0.009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0746  formimidoylglutamase  20.86 
 
 
319 aa  42.7  0.01  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>