17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1341 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_1341  hypothetical protein  100 
 
 
93 aa  192  9e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000228134  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0851  hypothetical protein  45.88 
 
 
88 aa  94.7  4e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00042014  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0664  hypothetical protein  47.06 
 
 
88 aa  89.4  2e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.408301  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1722  hypothetical protein  49.41 
 
 
90 aa  87  7e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.931421  normal  0.0430193 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1513  hypothetical protein  46.43 
 
 
86 aa  85.9  2e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.164782  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1878  hypothetical protein  43.48 
 
 
97 aa  84.7  4e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.600841  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19130  hypothetical protein  36.96 
 
 
105 aa  73.6  0.0000000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000879078  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0071  hypothetical protein  35.16 
 
 
97 aa  71.6  0.000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.788179 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1799  hypothetical protein  35.71 
 
 
90 aa  62  0.000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2116  hypothetical protein  28.57 
 
 
106 aa  57.4  0.00000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0498137  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1113  putative ComF operon protein  32.22 
 
 
92 aa  57.4  0.00000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0665799  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3069  putative ComF operon protein  35.29 
 
 
88 aa  55.1  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000296943  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0102  Late competence development protein ComFB  30.49 
 
 
106 aa  53.1  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1406  hypothetical protein  28.57 
 
 
233 aa  51.2  0.000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0542297  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1531  hypothetical protein  32.14 
 
 
168 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2422  late competence development protein ComFB  28.05 
 
 
177 aa  40.8  0.006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.491092  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1530  hypothetical protein  28.74 
 
 
185 aa  40.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>