14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_1132 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_1132  hypothetical protein  100 
 
 
148 aa  303  5.0000000000000004e-82  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.553572 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1347  hypothetical protein  46.53 
 
 
150 aa  129  1.0000000000000001e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0331737  hitchhiker  0.0000160464 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1922  hypothetical protein  34.94 
 
 
220 aa  59.3  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0722012 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2094  hypothetical protein  32.29 
 
 
186 aa  51.6  0.000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0202879  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2021  hypothetical protein  32.39 
 
 
232 aa  52  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000158905  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1472  hypothetical protein  27 
 
 
266 aa  50.1  0.000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0757  hypothetical protein  33.73 
 
 
205 aa  48.5  0.00003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.321867  normal  0.794251 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0556  hypothetical protein  26.62 
 
 
150 aa  47.8  0.00005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.472736  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0895  hypothetical protein  27.38 
 
 
289 aa  46.6  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00169761 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0542  hypothetical protein  21.12 
 
 
148 aa  44.7  0.0004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1191  hypothetical protein  27.17 
 
 
215 aa  43.9  0.0007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000156419  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3948  putative CbiL protein  35.63 
 
 
197 aa  42.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3208  putative CbiL protein  35.29 
 
 
197 aa  40.8  0.006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.487085  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1322  hypothetical protein  32.99 
 
 
210 aa  40.8  0.006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>