17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_1548 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_1548  hypothetical protein  100 
 
 
190 aa  390  1e-108  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1206  hypothetical protein  64.89 
 
 
192 aa  265  2.9999999999999995e-70  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.736669  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0780  hypothetical protein  59.47 
 
 
193 aa  252  2.0000000000000002e-66  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.247882  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1115  hypothetical protein  60.53 
 
 
190 aa  248  4e-65  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0928  hypothetical protein  57.89 
 
 
190 aa  228  3e-59  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1177  hypothetical protein  51.91 
 
 
183 aa  186  2e-46  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.518058 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1441  hypothetical protein  43.78 
 
 
183 aa  161  7e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.46496  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2653  hypothetical protein  39.89 
 
 
197 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.649476  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1555  hypothetical protein  39.57 
 
 
190 aa  134  9e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.247042  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0475  hypothetical protein  34.74 
 
 
195 aa  129  3e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.33606  normal  0.699739 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02070  hypothetical protein  32.97 
 
 
190 aa  125  3e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.273031  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4023  hypothetical protein  34.21 
 
 
192 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0523  hypothetical protein  29.1 
 
 
189 aa  116  1.9999999999999998e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2899  hypothetical protein  32.63 
 
 
199 aa  112  4.0000000000000004e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.503548 
 
 
-
 
NC_002950  PG0649  hypothetical protein  32.07 
 
 
194 aa  109  2.0000000000000002e-23  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.229996 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0933  hypothetical protein  29.89 
 
 
191 aa  104  8e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.96578  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2172  hypothetical protein  26.88 
 
 
190 aa  94.7  7e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>