17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_2172 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_2172  hypothetical protein  100 
 
 		 190 aa  389  1e-107  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02070  hypothetical protein  63.68 
 
 		 190 aa  263  8.999999999999999e-70  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.273031  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0523  hypothetical protein  61.9 
 
 		 189 aa  252  2.0000000000000002e-66  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2899  hypothetical protein  55.8 
 
 		 199 aa  223  1e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.503548 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0475  hypothetical protein  55.25 
 
 		 195 aa  212  1.9999999999999998e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.33606  normal  0.699739 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4023  hypothetical protein  51.91 
 
 		 192 aa  202  2e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0933  hypothetical protein  49.73 
 
 		 191 aa  199  1.9999999999999998e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.96578  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1555  hypothetical protein  52.75 
 
 		 190 aa  196  1.0000000000000001e-49  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.247042  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0649  hypothetical protein  46.84 
 
 		 194 aa  191  4e-48  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.229996 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2653  hypothetical protein  34.24 
 
 		 197 aa  141  5e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.649476  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0780  hypothetical protein  30.77 
 
 		 193 aa  105  5e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.247882  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0928  hypothetical protein  30.39 
 
 		 190 aa  102  3e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1441  hypothetical protein  30.22 
 
 		 183 aa  102  3e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.46496  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1548  hypothetical protein  26.88 
 
 		 190 aa  94.7  7e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1177  hypothetical protein  31.32 
 
 		 183 aa  94.4  1e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.518058 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1206  hypothetical protein  28.34 
 
 		 192 aa  92.4  4e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.736669  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1115  hypothetical protein  26.32 
 
 		 190 aa  90.5  1e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>