12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1023 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_1023  hypothetical protein  100 
 
 		 152 aa  306  1.0000000000000001e-82  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.271245  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4061  hypothetical protein  53.64 
 
 		 148 aa  157  6e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0620  hypothetical protein  44.76 
 
 		 146 aa  113  7.999999999999999e-25  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0764  hypothetical protein  41.26 
 
 		 146 aa  105  2e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.503732  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2513  hypothetical protein  42.38 
 
 		 148 aa  104  3e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3166  hypothetical protein  42.38 
 
 		 148 aa  104  5e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03856  hypothetical protein  38.93 
 
 		 147 aa  99.4  2e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.857117  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13541  hypothetical protein  37.5 
 
 		 147 aa  98.6  3e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61000  hypothetical protein  40.97 
 
 		 144 aa  98.2  4e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5250  hypothetical protein  39.46 
 
 		 144 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2694  hypothetical protein  38.89 
 
 		 166 aa  85.5  2e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3564  hypothetical protein  34.72 
 
 		 133 aa  42.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>