27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0342 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013162  Coch_0342  hypothetical protein  100 
 
 
147 aa  300  4.0000000000000003e-81  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0343  hypothetical protein  45.14 
 
 
148 aa  131  3e-30  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0344  hypothetical protein  40 
 
 
144 aa  108  2.0000000000000002e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0107  hypothetical protein  36.99 
 
 
147 aa  107  4.0000000000000004e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0718  hypothetical protein  36.91 
 
 
145 aa  101  4e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.255957 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2368  hypothetical protein  37.16 
 
 
144 aa  84.7  3e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0716  hypothetical protein  31.06 
 
 
140 aa  84.3  4e-16  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.596783  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1749  putative periplasmic protein  37.07 
 
 
190 aa  84.3  5e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  3.3259399999999995e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2196  hypothetical protein  31.62 
 
 
145 aa  82  0.000000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000750243  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1989  hypothetical protein  35.04 
 
 
148 aa  81.3  0.000000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1617  hypothetical protein  36.22 
 
 
138 aa  77  0.00000000000008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.901147  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2690  periplasmic protein  32.85 
 
 
141 aa  76.3  0.0000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0168099  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2092  hypothetical protein  28.87 
 
 
143 aa  75.9  0.0000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  1.25855e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1798  hypothetical protein  33.88 
 
 
138 aa  75.9  0.0000000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.455023  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0262  periplasmic protein  29.37 
 
 
143 aa  72.8  0.000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000483026  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1548  hypothetical protein  30.83 
 
 
139 aa  72.4  0.000000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2195  hypothetical protein  30.28 
 
 
145 aa  72.4  0.000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000372158  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2340  hypothetical protein  33.83 
 
 
141 aa  72.4  0.000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1279  hypothetical protein  29.05 
 
 
143 aa  67.4  0.00000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0785  hypothetical protein  29.93 
 
 
138 aa  65.5  0.0000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.270018  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1022  hypothetical protein  29.25 
 
 
138 aa  65.5  0.0000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.153989  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1084  hypothetical protein  28.57 
 
 
138 aa  64.3  0.0000000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2124  hypothetical protein  28.38 
 
 
139 aa  61.6  0.000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0731  conserved hypothetical protein, putative periplasmic protein  29.86 
 
 
136 aa  59.3  0.00000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000107511  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1737  hypothetical protein  26.05 
 
 
126 aa  45.4  0.0003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1819  hypothetical protein  26.19 
 
 
125 aa  44.7  0.0005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000253415  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1344  hypothetical protein  24.14 
 
 
156 aa  43.1  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>