28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0731 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012039  Cla_0731  conserved hypothetical protein, putative periplasmic protein  100 
 
 
136 aa  269  9e-72  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000107511  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1084  hypothetical protein  51.61 
 
 
138 aa  122  1e-27  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0785  hypothetical protein  50 
 
 
138 aa  121  4e-27  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.270018  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1022  hypothetical protein  50 
 
 
138 aa  120  9e-27  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.153989  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2340  hypothetical protein  52.52 
 
 
141 aa  118  3e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2690  periplasmic protein  44.2 
 
 
141 aa  110  6e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0168099  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1749  putative periplasmic protein  44.17 
 
 
190 aa  109  1.0000000000000001e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  3.3259399999999995e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1548  hypothetical protein  36.76 
 
 
139 aa  103  9e-22  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1279  hypothetical protein  41.26 
 
 
143 aa  102  1e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0716  hypothetical protein  44.12 
 
 
140 aa  102  2e-21  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.596783  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0262  periplasmic protein  38.89 
 
 
143 aa  98.6  3e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000483026  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2124  hypothetical protein  41.01 
 
 
139 aa  97.8  5e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1617  hypothetical protein  42.28 
 
 
138 aa  96.7  1e-19  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.901147  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2092  hypothetical protein  36.43 
 
 
143 aa  95.9  2e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  1.25855e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1798  hypothetical protein  42.86 
 
 
138 aa  94.7  3e-19  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.455023  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1737  hypothetical protein  37.7 
 
 
126 aa  69.7  0.00000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2196  hypothetical protein  31.82 
 
 
145 aa  63.2  0.000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000750243  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0343  hypothetical protein  29.33 
 
 
148 aa  59.7  0.00000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2195  hypothetical protein  30.58 
 
 
145 aa  60.1  0.00000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000372158  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0342  hypothetical protein  29.86 
 
 
147 aa  59.3  0.00000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2368  hypothetical protein  31.21 
 
 
144 aa  57.8  0.00000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0718  hypothetical protein  25.35 
 
 
145 aa  50.4  0.000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.255957 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1750  putative periplasmic protein  42.59 
 
 
83 aa  48.9  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000122989  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0107  hypothetical protein  27.97 
 
 
147 aa  46.6  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1410  hypothetical protein  36.84 
 
 
99 aa  44.7  0.0005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1819  hypothetical protein  31.45 
 
 
125 aa  43.1  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000253415  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1989  hypothetical protein  24.35 
 
 
148 aa  43.1  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1772  hypothetical protein  29.76 
 
 
134 aa  41.6  0.004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00415714  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>