17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1612 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010803  Clim_1612  hypothetical protein  100 
 
 
130 aa  257  4e-68  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00226561  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1046  hypothetical protein  68.46 
 
 
143 aa  182  1.0000000000000001e-45  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000643846  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1239  hypothetical protein  71.07 
 
 
192 aa  172  1.9999999999999998e-42  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.86587  normal  0.341042 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0970  hypothetical protein  68.38 
 
 
125 aa  164  5e-40  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.1187  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1674  hypothetical protein  68.46 
 
 
132 aa  164  5e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.664876  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1239  hypothetical protein  60.16 
 
 
135 aa  145  2.0000000000000003e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0212836  normal  0.226179 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0949  hypothetical protein  61.48 
 
 
136 aa  144  5e-34  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.451912 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1885  hypothetical protein  39.2 
 
 
302 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0070787  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2340  hypothetical protein  37.5 
 
 
128 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.897475  normal  0.976398 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1659  hypothetical protein  36.8 
 
 
302 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.210823  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1934  hypothetical protein  35.2 
 
 
302 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00883749  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1858  hypothetical protein  35.2 
 
 
302 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.4227900000000003e-34 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3519  hypothetical protein  37.1 
 
 
302 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1678  hypothetical protein  37.38 
 
 
167 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1624  hypothetical protein  35.77 
 
 
302 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0119502  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1677  hypothetical protein  35.48 
 
 
302 aa  62.4  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.366521  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5337  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.82 
 
 
417 aa  43.5  0.0009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.306348  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>