17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1115 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_1115  hypothetical protein  100 
 
 		 190 aa  392  1e-108  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1206  hypothetical protein  65.78 
 
 		 192 aa  270  1e-71  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.736669  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0780  hypothetical protein  61.58 
 
 		 193 aa  258  5.0000000000000005e-68  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.247882  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0928  hypothetical protein  60.53 
 
 		 190 aa  248  3e-65  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1548  hypothetical protein  60.53 
 
 		 190 aa  248  4e-65  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1177  hypothetical protein  55.74 
 
 		 183 aa  209  3e-53  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.518058 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1441  hypothetical protein  45.16 
 
 		 183 aa  170  1e-41  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.46496  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2653  hypothetical protein  36.22 
 
 		 197 aa  118  3.9999999999999996e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.649476  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4023  hypothetical protein  31.18 
 
 		 192 aa  117  9e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0475  hypothetical protein  33.51 
 
 		 195 aa  115  3e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.33606  normal  0.699739 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1555  hypothetical protein  34.21 
 
 		 190 aa  112  3e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.247042  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02070  hypothetical protein  29.1 
 
 		 190 aa  109  2.0000000000000002e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.273031  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0649  hypothetical protein  32.98 
 
 		 194 aa  107  9.000000000000001e-23  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.229996 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2899  hypothetical protein  31.89 
 
 		 199 aa  106  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.503548 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0523  hypothetical protein  29.71 
 
 		 189 aa  105  4e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0933  hypothetical protein  31.11 
 
 		 191 aa  99.8  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.96578  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2172  hypothetical protein  26.32 
 
 		 190 aa  90.5  1e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>