13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1106 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010803  Clim_1106  hypothetical protein  100 
 
 
99 aa  194  4.0000000000000005e-49  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0991  hypothetical protein  55.41 
 
 
76 aa  75.5  0.0000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1531  hypothetical protein  56.25 
 
 
66 aa  69.7  0.00000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.707315  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0918  hypothetical protein  73.53 
 
 
116 aa  60.1  0.000000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.895218  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1697  hypothetical protein  64.86 
 
 
50 aa  59.7  0.00000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1500  hypothetical protein  62.86 
 
 
85 aa  55.1  0.0000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1450  hypothetical protein  46.3 
 
 
64 aa  53.9  0.0000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.330959  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1185  hypothetical protein  42.19 
 
 
115 aa  53.1  0.000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000250834  normal  0.746825 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1271  hypothetical protein  52.94 
 
 
61 aa  50.4  0.000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.135008  normal  0.0172039 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0775  hypothetical protein  51.43 
 
 
66 aa  47.8  0.00005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1581  hypothetical protein  45.71 
 
 
57 aa  43.9  0.0007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000329754  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0904  hypothetical protein  36.36 
 
 
89 aa  43.5  0.0009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0646  hypothetical protein  40.54 
 
 
146 aa  42.4  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.722442  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>