15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_1410 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012039  Cla_1410  hypothetical protein  100 
 
 
99 aa  207  3e-53  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1749  putative periplasmic protein  43.4 
 
 
190 aa  54.3  0.0000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  3.3259399999999995e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2092  hypothetical protein  43.4 
 
 
143 aa  53.9  0.0000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  1.25855e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0716  hypothetical protein  49.06 
 
 
140 aa  53.1  0.000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.596783  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1798  hypothetical protein  47.92 
 
 
138 aa  50.1  0.00001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.455023  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1548  hypothetical protein  43.4 
 
 
139 aa  50.1  0.00001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1279  hypothetical protein  35.71 
 
 
143 aa  47.8  0.00005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1617  hypothetical protein  43.75 
 
 
138 aa  47.4  0.00006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.901147  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1750  putative periplasmic protein  28 
 
 
83 aa  46.6  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000122989  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0731  conserved hypothetical protein, putative periplasmic protein  36.84 
 
 
136 aa  44.7  0.0005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000107511  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2124  hypothetical protein  33.93 
 
 
139 aa  44.3  0.0006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0262  periplasmic protein  40.82 
 
 
143 aa  43.5  0.0008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000483026  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2195  hypothetical protein  33.33 
 
 
145 aa  42.4  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000372158  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2690  periplasmic protein  36.73 
 
 
141 aa  42  0.003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0168099  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0718  hypothetical protein  39.53 
 
 
145 aa  40  0.009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.255957 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>