15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0008 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_0008  hypothetical protein  100 
 
 		 111 aa  231  4.0000000000000004e-60  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0004  hypothetical protein  74.07 
 
 		 113 aa  163  6.9999999999999995e-40  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.408251  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0030  hypothetical protein  74.07 
 
 		 113 aa  163  8e-40  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.593403  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2873  hypothetical protein  43.82 
 
 		 131 aa  84.3  5e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3243  hypothetical protein  40.91 
 
 		 131 aa  79.3  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.984975  normal  0.679111 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3623  hypothetical protein  38.64 
 
 		 135 aa  69.7  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.599999  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0716  monoheme cytochrome c, putative  40.57 
 
 		 127 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0008  monoheme cytochrome c, putative  35.85 
 
 		 127 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0008  monoheme cytochrome c, putative  35.85 
 
 		 127 aa  65.5  0.0000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0100224 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0008  monoheme cytochrome c, putative  34.91 
 
 		 127 aa  63.9  0.0000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000351615 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6938  hypothetical protein  39.53 
 
 		 183 aa  62.4  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0980  hypothetical protein  34.78 
 
 		 129 aa  61.2  0.000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00330636  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1174  hypothetical protein  35.24 
 
 		 126 aa  59.3  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000759972 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2982  hypothetical protein  35.85 
 
 		 116 aa  44.7  0.0005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4082  hypothetical protein  36.54 
 
 		 121 aa  41.2  0.006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>