16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_1573 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_1573  VTC domain protein  100 
 
 
294 aa  575  1.0000000000000001e-163  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.375137  hitchhiker  0.00558819 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3221  hypothetical protein  56.63 
 
 
281 aa  223  2e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3209  hypothetical protein  53.03 
 
 
268 aa  201  9.999999999999999e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.435311  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3226  hypothetical protein  53.88 
 
 
260 aa  199  5e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1904  hypothetical protein  48.97 
 
 
265 aa  195  6e-49  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3117  hypothetical protein  51.22 
 
 
265 aa  194  2e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0313259  normal  0.140705 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13050  VTC domain-containing protein  48.29 
 
 
259 aa  175  9e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03050  VTC domain-containing protein  46.44 
 
 
283 aa  160  2e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0852  hypothetical protein  42.86 
 
 
277 aa  145  6e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.538253  normal  0.0167402 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4902  major facilitator superfamily MFS_1  39.69 
 
 
735 aa  135  5e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.283889  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4795  VTC domain protein  39.66 
 
 
286 aa  136  5e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2551  hypothetical protein  35.66 
 
 
282 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.569543  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1332  hypothetical protein  39.08 
 
 
251 aa  113  3e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2816  hypothetical protein  29.34 
 
 
280 aa  107  2e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.850496  normal  0.117203 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1490  hypothetical protein  28.93 
 
 
280 aa  103  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00472854  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3873  hypothetical protein  30.38 
 
 
267 aa  95.5  9e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.212389 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>