18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_1650 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_1650  protein of unknown function DUF1634  100 
 
 
118 aa  216  7e-56  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.12179  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3868  protein of unknown function DUF1634  57.39 
 
 
121 aa  130  6.999999999999999e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0290618  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2524  hypothetical protein  46.02 
 
 
125 aa  92.4  2e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0192345  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1844  hypothetical protein  43.86 
 
 
124 aa  77  0.00000000000008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0601  protein of unknown function DUF1634  40.91 
 
 
131 aa  68.2  0.00000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0944  hypothetical protein  41.28 
 
 
130 aa  63.2  0.000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3309  protein of unknown function DUF1634  33.33 
 
 
132 aa  55.1  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.339425  hitchhiker  0.000416312 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0269  hypothetical protein  29.36 
 
 
104 aa  49.7  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1198  hypothetical protein  25.86 
 
 
103 aa  48.9  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3318  hypothetical protein  31.86 
 
 
135 aa  47.8  0.00006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1177  hypothetical protein  26.32 
 
 
107 aa  45.1  0.0003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.11532  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3138  protein of unknown function DUF1634  38.05 
 
 
119 aa  45.1  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1080  hypothetical protein  26.32 
 
 
107 aa  45.1  0.0003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0478785  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1183  hypothetical protein  40 
 
 
119 aa  43.9  0.0007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.529449 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4143  hypothetical protein  34.43 
 
 
101 aa  43.9  0.0007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.250184  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1909  hypothetical protein  37.74 
 
 
122 aa  43.1  0.001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.110059  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2211  protein of unknown function DUF1634  39.58 
 
 
99 aa  42.4  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000237451  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0548  hypothetical protein  31.93 
 
 
127 aa  41.6  0.004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.835755  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>