15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_4716 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_4716  hypothetical protein  100 
 
 
321 aa  663    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.428888  normal  0.0726517 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6250  hypothetical protein  38.49 
 
 
310 aa  194  2e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.139309  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_6234  hypothetical protein  33.23 
 
 
338 aa  182  7e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2026  hypothetical protein  33.96 
 
 
310 aa  169  4e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.121874  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0798  hypothetical protein  24.92 
 
 
307 aa  63.9  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0261  hypothetical protein  26.22 
 
 
303 aa  62  0.00000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.205526  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2563  hypothetical protein  21.5 
 
 
304 aa  58.5  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0074  hypothetical protein  22.55 
 
 
309 aa  55.1  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000070418  n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08196  hypothetical protein  25.7 
 
 
274 aa  52.4  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  hitchhiker  0.00000170796  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1885  hypothetical protein  23.62 
 
 
288 aa  51.2  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.911612 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2315  hypothetical protein  22.37 
 
 
296 aa  49.3  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.106853  hitchhiker  0.000000000000558489 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0963  hypothetical protein  25.44 
 
 
365 aa  47.4  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.369617  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3495  hypothetical protein  23.9 
 
 
276 aa  46.2  0.0008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0240  hypothetical protein  25.85 
 
 
290 aa  45.8  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1649  hypothetical protein  25.55 
 
 
274 aa  43.1  0.006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.432038  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>