21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_1066 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007514  Cag_1066  hypothetical protein  100 
 
 
93 aa  193  5.000000000000001e-49  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1142  hypothetical protein  67.9 
 
 
89 aa  122  2e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1449  hypothetical protein  59.26 
 
 
90 aa  105  2e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1134  hypothetical protein  55.56 
 
 
118 aa  101  3e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.372045  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0240  hypothetical protein  31.33 
 
 
94 aa  53.1  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0903  hypothetical protein  41.33 
 
 
86 aa  53.5  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.50164  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1211  molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein A  37.68 
 
 
114 aa  52.8  0.000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.56263  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00619  hypothetical protein  34.52 
 
 
86 aa  49.3  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1018  hypothetical protein  30.26 
 
 
106 aa  49.3  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3398  molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein A-like protein  36.36 
 
 
89 aa  47  0.00008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0923  hypothetical protein  33.33 
 
 
91 aa  46.6  0.0001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1439  hypothetical protein  30.77 
 
 
81 aa  45.8  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.766966  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1246  hypothetical protein  30.68 
 
 
103 aa  45.8  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.388474  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0271  hypothetical protein  24.72 
 
 
88 aa  45.4  0.0003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2429  hypothetical protein  31.11 
 
 
110 aa  44.7  0.0004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2523  hypothetical protein  33.33 
 
 
88 aa  44.3  0.0005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1477  hypothetical protein  32.1 
 
 
104 aa  43.1  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0662  hypothetical protein  34.62 
 
 
117 aa  42  0.003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.6245  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1993  hypothetical protein  29.87 
 
 
95 aa  41.2  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0558528  normal  0.0422731 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2137  hypothetical protein  31.75 
 
 
89 aa  40.4  0.009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.309843  n/a   
 
 
-
 
NC_009472  Acry_3622  hypothetical protein  30.3 
 
 
84 aa  40  0.01  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>