22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_8251 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_8251  thiamineS protein  100 
 
 		 83 aa  158  2e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0445  thiamine S  55.7 
 
 		 97 aa  85.9  2e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0454  thiamineS protein  60.98 
 
 		 82 aa  81.3  0.000000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.132954  normal  0.504318 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2024  thiamineS protein  56.96 
 
 		 92 aa  80.9  0.000000000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.930246  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0596  thiamineS protein  55.56 
 
 		 84 aa  73.6  0.0000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0896  molybdopterin converting factor, subunit 1  55.56 
 
 		 83 aa  72  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6174  thiamineS protein  56.25 
 
 		 84 aa  64.3  0.0000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.156031 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4962  thiamineS protein  48.1 
 
 		 82 aa  64.3  0.0000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.806952  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2736  putative molybdopterin converting factor  50 
 
 		 102 aa  63.5  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4239  thiamineS protein  45.78 
 
 		 90 aa  60.5  0.000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.312253  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1243  hypothetical protein  43.75 
 
 		 84 aa  59.3  0.00000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00015012  normal  0.456438 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0470  thiamineS protein  44.71 
 
 		 87 aa  54.7  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19310  molybdopterin converting factor, small subunit  49.4 
 
 		 79 aa  54.3  0.0000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0344734  normal  0.0247998 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1691  thiamineS protein  44.44 
 
 		 103 aa  53.9  0.0000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.319795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5047  thiamineS protein  50 
 
 		 99 aa  49.7  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0107855 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34170  molybdopterin converting factor, small subunit  41.86 
 
 		 103 aa  47.4  0.00007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.176144  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1754  thiamineS protein  46.34 
 
 		 94 aa  47  0.00008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.593582  hitchhiker  0.00626115 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4537  thiamineS protein  48.75 
 
 		 98 aa  46.6  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.708821 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20020  hypothetical protein  39.53 
 
 		 79 aa  42  0.003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00891223 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4375  thiamineS protein  60 
 
 		 85 aa  41.6  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4752  thiamineS protein  43.48 
 
 		 100 aa  41.2  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0225  molybdopterin converting factor, subunit 1  27.06 
 
 		 80 aa  40.8  0.006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000241588  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>