38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_8093 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_8093  hypothetical protein  100 
 
 		 761 aa  1446    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0814  hypothetical protein  44.11 
 
 		 790 aa  420  1e-116  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8905  hypothetical protein  41.93 
 
 		 789 aa  415  1e-114  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.826763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3610  hypothetical protein  44.13 
 
 		 789 aa  413  1e-114  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.746479  normal  0.160481 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3295  hypothetical protein  41.01 
 
 		 857 aa  396  1e-109  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.255301 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4401  hypothetical protein  40.28 
 
 		 837 aa  396  1e-109  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.433686  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0172  hypothetical protein  40.67 
 
 		 876 aa  379  1e-104  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.211375 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34230  hypothetical protein  40.88 
 
 		 751 aa  372  1e-101  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.604302  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0463  hypothetical protein  41.43 
 
 		 747 aa  361  3e-98  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.391132  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4339  hypothetical protein  37.81 
 
 		 820 aa  343  9e-93  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0804  hypothetical protein  39.35 
 
 		 752 aa  316  9.999999999999999e-85  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.613631  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3948  hypothetical protein  37.87 
 
 		 820 aa  311  2e-83  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0508  hypothetical protein  37.84 
 
 		 759 aa  306  8.000000000000001e-82  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4484  hypothetical protein  36.57 
 
 		 739 aa  303  7.000000000000001e-81  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4571  hypothetical protein  36.57 
 
 		 764 aa  303  7.000000000000001e-81  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0747645 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4867  hypothetical protein  36.43 
 
 		 764 aa  303  8.000000000000001e-81  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0900282 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3945  hypothetical protein  40.94 
 
 		 758 aa  302  1e-80  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.404517  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4772  hypothetical protein  37.77 
 
 		 758 aa  296  8e-79  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5054  hypothetical protein  35.23 
 
 		 751 aa  273  8.000000000000001e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1699  hypothetical protein  35.73 
 
 		 748 aa  272  2e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.713672 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10879  hypothetical protein  36.6 
 
 		 756 aa  270  7e-71  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.112586 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0788  hypothetical protein  35 
 
 		 834 aa  267  7e-70  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0906  hypothetical protein  32.59 
 
 		 826 aa  259  1e-67  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.504843 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1222  hypothetical protein  39.18 
 
 		 777 aa  255  2.0000000000000002e-66  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0847  hypothetical protein  34.93 
 
 		 762 aa  245  3e-63  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.435932  normal  0.0125062 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31420  hypothetical protein  41.57 
 
 		 953 aa  239  1e-61  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.937123  normal  0.115197 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0726  hypothetical protein  37.45 
 
 		 817 aa  227  8e-58  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0231396  hitchhiker  0.000141757 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0815  hypothetical protein  34.64 
 
 		 726 aa  216  9.999999999999999e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2510  hypothetical protein  32.61 
 
 		 798 aa  213  1e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.90638 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21530  hypothetical protein  33.85 
 
 		 779 aa  211  4e-53  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.636597  hitchhiker  0.000150797 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2931  hypothetical protein  44.5 
 
 		 745 aa  209  1e-52  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2048  hypothetical protein  32.76 
 
 		 822 aa  207  4e-52  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3427  hypothetical protein  29.96 
 
 		 840 aa  152  2e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07970  hypothetical protein  36.07 
 
 		 719 aa  145  2e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.281688  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1917  hypothetical protein  22.31 
 
 		 557 aa  65.9  0.000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00808951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1999  hypothetical protein  28.03 
 
 		 856 aa  56.2  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0638496 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2932  type III restriction protein res subunit  30.6 
 
 		 558 aa  44.3  0.008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.406282  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5357  hypothetical protein  30.43 
 
 		 449 aa  43.9  0.01  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>