17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6639 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_6639  hypothetical protein  100 
 
 
112 aa  218  1.9999999999999999e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0740219 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6546  hypothetical protein  75.51 
 
 
100 aa  119  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0240638  normal  0.044822 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1804  hypothetical protein  36.36 
 
 
111 aa  52.4  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.45464  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2357  hypothetical protein  52.38 
 
 
104 aa  52.4  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0871  hypothetical protein  34.85 
 
 
101 aa  50.1  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.272894  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0767  hypothetical protein  37.88 
 
 
113 aa  50.1  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3183  hypothetical protein  35.37 
 
 
138 aa  49.3  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0105662  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0807  secreted protein  50 
 
 
110 aa  48.5  0.00003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0257715 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0934  hypothetical protein  54.76 
 
 
88 aa  47.8  0.00006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.860281  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6840  secreted protein  55.26 
 
 
103 aa  47  0.00009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0260  hypothetical protein  32.04 
 
 
178 aa  45.8  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1190  hypothetical protein  45.24 
 
 
101 aa  45.8  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04280  hypothetical protein  40.28 
 
 
81 aa  46.2  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26160  hypothetical protein  33.8 
 
 
128 aa  45.1  0.0004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1937  hypothetical protein  47.37 
 
 
61 aa  43.9  0.0008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.20896  hitchhiker  0.00316318 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3199  hypothetical protein  40.98 
 
 
106 aa  43.5  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000230213 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17500  hypothetical protein  47.62 
 
 
130 aa  42.4  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.720482  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>