10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_2408 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_2408  hypothetical protein  100 
 
 		 160 aa  316  7.999999999999999e-86  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1096  Polyketide cyclase/dehydrase  47.83 
 
 		 155 aa  113  1.0000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.446959  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5814  hypothetical protein  42.19 
 
 		 189 aa  110  6e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.220711  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06350  Polyketide cyclase / dehydrase and lipid transport  41.3 
 
 		 149 aa  109  2.0000000000000002e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1177  hypothetical protein  52.73 
 
 		 153 aa  105  3e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00189293  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0780  hypothetical protein  47.66 
 
 		 143 aa  94.7  5e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2147  hypothetical protein  34.62 
 
 		 177 aa  84.3  6e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00483814  hitchhiker  0.00933127 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0651  hypothetical protein  31.39 
 
 		 173 aa  70.5  0.000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.125343  hitchhiker  0.00237783 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0704  hypothetical protein  33.58 
 
 		 173 aa  69.3  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.673161  normal  0.376338 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1459  hypothetical protein  33.33 
 
 		 155 aa  60.8  0.000000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.338735  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>