34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_4634 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003910  CPS_4634  putative molybdopterin biosynthesis gene  100 
 
 
218 aa  449  1e-125  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.584384  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2159  putative molybdopterin biosynthesis gene  29.6 
 
 
230 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.43683  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2171  molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein A  30.39 
 
 
195 aa  80.5  0.00000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.755723  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02349  molybdopterin guanine dinucleotide synthase  28.7 
 
 
211 aa  78.2  0.00000000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01478  molybdopterin guanine dinucleotide synthase  31.1 
 
 
186 aa  77  0.0000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03861  molybdopterin guanine dinucleotide synthase  35.19 
 
 
197 aa  74.7  0.0000000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2239  molybdopterin guanine dinucleotide synthase  30.29 
 
 
182 aa  72.4  0.000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.454592  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2710  molybdenum cofactor guanylyltransferase  30 
 
 
184 aa  58.5  0.00000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.109842 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1986  molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein A  25.7 
 
 
206 aa  53.1  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.691295 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1231  Molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein A-like protein  24.23 
 
 
290 aa  52  0.000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0327481 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0553  molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein A, putative  38.02 
 
 
222 aa  52  0.000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3162  molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein A-like protein  29.86 
 
 
205 aa  48.5  0.00007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1851  molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein MobA  26.67 
 
 
204 aa  47.8  0.0001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2294  molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein MobA  26.67 
 
 
199 aa  47  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.474178  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2336  molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein MobA  26.67 
 
 
199 aa  47  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.567855  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0708  molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein A, putative  31.9 
 
 
208 aa  46.6  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2265  molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein A  30.22 
 
 
209 aa  46.6  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00364029  normal  0.0280987 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2373  molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein A, putative  27.1 
 
 
222 aa  45.4  0.0006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4642  molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein A-like protein  30.99 
 
 
190 aa  45.1  0.0008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0143  putative bifunctional molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein MobB/MobA  27.03 
 
 
376 aa  44.7  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.106772  normal  0.648703 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0125  putative molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein  25.22 
 
 
184 aa  43.5  0.002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2052  molybdopterin guanine dinucleotide synthase  25.48 
 
 
206 aa  43.9  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.214617  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2410  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  26.36 
 
 
194 aa  44.3  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0984  molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein A  28.07 
 
 
266 aa  43.9  0.002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.806848 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3075  molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein A  25.73 
 
 
191 aa  43.5  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0147556  unclonable  0.00000746757 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2313  putative bifunctional molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein MobB/MobA  27.15 
 
 
370 aa  42.7  0.004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4590  molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein A  28.69 
 
 
200 aa  42.7  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0724  molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein A  28 
 
 
195 aa  42.7  0.004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.417941  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1584  molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein MobA  31.86 
 
 
219 aa  42.4  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.105133  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1060  putative bifunctional molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein MobB/MobA  26.94 
 
 
368 aa  42.4  0.005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00320944  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0278  molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein A, putative  29.13 
 
 
215 aa  42.4  0.006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1466  molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein A-like protein  23.61 
 
 
202 aa  42  0.007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2473  putative bifunctional molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein MobB/MobA  24.32 
 
 
496 aa  41.6  0.009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2259  molybdenum cofactor guanylyltransferase  24.57 
 
 
222 aa  41.6  0.009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.576692  normal  0.586206 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>