26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_4198 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_4198  putative alpha-1,2-fucosyltransferase  100 
 
 		 294 aa  615  1e-175  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0146  glycosyl transferase family 11  42.66 
 
 		 283 aa  235  6e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0338  glycosyl transferase family protein  41.02 
 
 		 285 aa  224  1e-57  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0807191  hitchhiker  0.0000349677 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1679  glycosyl transferase family protein  36.72 
 
 		 295 aa  181  2e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2194  glycosyl transferase family 11  36 
 
 		 295 aa  179  5.999999999999999e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0826707  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1328  glycosyl transferase family protein  35.47 
 
 		 294 aa  159  5e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2748  glycosyl transferase family 11  32.01 
 
 		 291 aa  142  6e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1787  glycosyl transferase family 11  32.51 
 
 		 295 aa  141  9.999999999999999e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2877  alpha-1,2-fucosyltransferase, putative  28.47 
 
 		 292 aa  132  5e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0942  glycosyl transferase family 11  29.74 
 
 		 290 aa  127  2.0000000000000002e-28  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1924  glycosyl transferase family 11  31.58 
 
 		 283 aa  122  8e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0942208 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2552  glycosyl transferase family 11  29.9 
 
 		 300 aa  122  9e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2699  glycosyl transferase family 11  30.1 
 
 		 280 aa  120  3e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00742105 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1779  hypothetical protein  28.92 
 
 		 289 aa  105  7e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1149  glycosyl transferase family protein  31.03 
 
 		 314 aa  90.9  2e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000226054  hitchhiker  0.000000000419037 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1971  glycosyl transferase family 11  24.82 
 
 		 270 aa  81.3  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.433733  hitchhiker  0.0000000182998 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0178  glycosyl transferase family 11  25.63 
 
 		 269 aa  72  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.454598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1774  glycosyl transferase family 11  25.61 
 
 		 268 aa  64.3  0.000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0268354  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0313  hypothetical protein  24.87 
 
 		 301 aa  60.5  0.00000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.033125  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03891  glycosyl transferase family protein  26.1 
 
 		 277 aa  56.6  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1801  glycosyl transferase family protein  30.08 
 
 		 279 aa  53.9  0.000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.124844  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2087  hypothetical protein  28.47 
 
 		 276 aa  50.8  0.00002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1386  glycosyl transferase family protein  21.13 
 
 		 256 aa  50.4  0.00004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0615107  hitchhiker  0.0000880279 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03901  glycosyl transferase family protein  24.75 
 
 		 280 aa  49.3  0.00008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0560528  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1141  glycosyl transferase family 11  28.49 
 
 		 261 aa  48.5  0.0001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.565548  normal  0.0912925 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2369  glycosyl transferase family protein  21.43 
 
 		 241 aa  46.6  0.0005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>