24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_4026 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_4026  hypothetical protein  100 
 
 		 75 aa  155  2e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3923  formate dehydrogenase protein, delta subunit  37.33 
 
 		 81 aa  52  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.539017  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3634  NAD-dependent formate dehydrogenase, delta subunit protein  36 
 
 		 81 aa  49.7  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.397021 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2851  hypothetical protein  36.99 
 
 		 73 aa  46.2  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.524907  normal  0.621518 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0253  hypothetical protein  31.82 
 
 		 80 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0312238  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1082  formate dehydrogenase delta subunit  36.99 
 
 		 73 aa  45.4  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2743  NAD-dependent formate dehydrogenase, delta subunit  36.99 
 
 		 73 aa  45.4  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.410603 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4095  NAD-dependent formate dehydrogenase delta subunit  35.62 
 
 		 90 aa  44.7  0.0005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.763702  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0906  formate dehydrogenase, delta subunit  34.92 
 
 		 83 aa  44.3  0.0006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.104938 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0894  formate dehydrogenase, delta subunit  34.92 
 
 		 83 aa  44.3  0.0006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.222055  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0989  hypothetical protein  33.96 
 
 		 83 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.474729  normal  0.384046 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2367  formate dehydrogenase, delta subunit  40.48 
 
 		 83 aa  42.7  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.80224 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2965  formate dehydrogenase, delta subunit  36.73 
 
 		 86 aa  42.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2903  formate dehydrogenase, delta subunit  36.73 
 
 		 86 aa  42.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2596  formate dehydrogenase, delta subunit  36.73 
 
 		 86 aa  42.4  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.576225  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1030  hypothetical protein  39.53 
 
 		 83 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0551  hypothetical protein  39.53 
 
 		 83 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.946361  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1621  formate dehydrogenase, delta subunit  36.73 
 
 		 86 aa  42.7  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.623732  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3013  NAD-dependent formate dehydrogenase delta subunit  36.73 
 
 		 86 aa  42.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0451  formate dehydrogenase, delta subunit  36.73 
 
 		 86 aa  42.4  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.824434  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4143  formate dehydrogenase delta subunit  41.03 
 
 		 83 aa  41.6  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.143558  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4407  hypothetical protein  38.24 
 
 		 146 aa  41.2  0.005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4870  hypothetical protein  38.24 
 
 		 96 aa  41.2  0.005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0372261 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1862  NAD-dependent formate dehydrogenase, delta subunit  37.31 
 
 		 76 aa  40  0.01  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>