32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_3758 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_3758  putative primosomal replication protein N''  100 
 
 		 227 aa  456  1e-127  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1564  primosomal replication protein N'', putative  28.7 
 
 		 222 aa  72.8  0.000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.857042  hitchhiker  0.0000269133 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1247  primosomal replication protein N'', putative  26.84 
 
 		 220 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000103965 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1511  primosomal replication protein N'', putative  25.76 
 
 		 220 aa  63.5  0.000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2472  primosomal replication protein N'', putative  24.74 
 
 		 222 aa  62.8  0.000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00169187 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2540  primosomal replication protein N'', putative  24.74 
 
 		 222 aa  61.6  0.000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00171474 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1817  primosomal replication protein n'', putative  24.74 
 
 		 222 aa  61.2  0.00000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3088  primosomal replication protein N'', putative  27.16 
 
 		 224 aa  61.2  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.647764  hitchhiker  0.0000204768 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2632  primosomal replication protein N'', putative  24.74 
 
 		 222 aa  60.8  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.945  hitchhiker  0.00346674 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2485  primosomal replication protein N'', putative  26.13 
 
 		 220 aa  59.3  0.00000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0159891 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2632  primosomal replication protein N'', putative  27.17 
 
 		 220 aa  58.9  0.00000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1616  primosomal replication protein N'', putative  29.29 
 
 		 220 aa  58.5  0.00000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.249114  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1627  primosomal replication protein N'', putative  29.29 
 
 		 220 aa  58.5  0.00000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2431  primosomal replication protein N'', putative  24.44 
 
 		 220 aa  58.5  0.00000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1650  primosomal replication protein N'', putative  29.29 
 
 		 220 aa  58.5  0.00000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.43387 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2727  primosomal replication protein N'', putative  29.29 
 
 		 220 aa  58.5  0.00000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.794988  hitchhiker  0.000571866 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1132  primosomal replication priB and priC  43.24 
 
 		 178 aa  57.4  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000181094 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2658  primosomal replication protein N'', putative  29.1 
 
 		 220 aa  57.8  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3238  Primosomal replication priB and priC  42.03 
 
 		 178 aa  53.5  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.104789  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1073  Primosomal replication priB and priC  42.03 
 
 		 178 aa  53.1  0.000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0102132  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3062  primosomal replication protein n''  28.09 
 
 		 178 aa  52.4  0.000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2885  primosomal replication protein n''  28.09 
 
 		 178 aa  52.4  0.000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0303464 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3202  primosomal replication priB and priC  28.09 
 
 		 178 aa  52.4  0.000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3043  Primosomal replication priB and priC  41.18 
 
 		 177 aa  51.6  0.000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003965  primosomal replication protein N''  26.07 
 
 		 181 aa  51.6  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0128436  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1015  Primosomal replication priB and priC  40 
 
 		 178 aa  47  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.265941  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0947  primosomal replication protein N''  29.38 
 
 		 175 aa  46.6  0.0003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.815884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1448  primosomal replication protein N``  38.57 
 
 		 187 aa  45.1  0.0008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000618679  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01555  primosomal replication protein N''  34.78 
 
 		 181 aa  43.9  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3149  primosomal replication protein N''  42.59 
 
 		 175 aa  43.1  0.004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.119522  normal  0.373691 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0544  primosomal replication protein N''  42.59 
 
 		 175 aa  43.1  0.004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0510  primosomal replication protein N''  42.59 
 
 		 175 aa  41.6  0.01  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00536071  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>