61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_2643 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003910  CPS_2643  acetyltransferase  100 
 
 
135 aa  276  6e-74  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.355303  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2958  GCN5-related N-acetyltransferase  44.78 
 
 
152 aa  135  2e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0822449  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1781  GCN5-related N-acetyltransferase  41.48 
 
 
151 aa  122  2e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4380  GCN5-related N-acetyltransferase  39.1 
 
 
167 aa  117  3.9999999999999996e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.89832  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1084  GCN5-related N-acetyltransferase  39.26 
 
 
148 aa  109  1.0000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.146915  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1327  GCN5-related N-acetyltransferase  36.72 
 
 
152 aa  107  5e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.934775  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4143  GCN5-related N-acetyltransferase  37.19 
 
 
150 aa  84.7  4e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.172153 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1580  GCN5-related N-acetyltransferase  32.06 
 
 
145 aa  68.9  0.00000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0548587  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0923  GCN5-related N-acetyltransferase  31.06 
 
 
146 aa  65.5  0.0000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.202356  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0376  GCN5-related N-acetyltransferase  39.71 
 
 
133 aa  49.7  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1673  GCN5-related N-acetyltransferase  25.17 
 
 
157 aa  48.1  0.00004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0181095 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1841  GCN5-related N-acetyltransferase  25.85 
 
 
157 aa  47.8  0.00005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.156651  normal  0.303536 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7262  acetyltransferase  33.68 
 
 
157 aa  47.4  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4025  GCN5-related N-acetyltransferase  31.58 
 
 
157 aa  46.2  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.636183  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003177  acetyltransferase  35.96 
 
 
138 aa  46.2  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3487  GCN5-related N-acetyltransferase  29.29 
 
 
174 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0612  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  34.48 
 
 
148 aa  46.2  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3814  GCN5-related N-acetyltransferase  31.25 
 
 
177 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00104394 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2040  GCN5-related N-acetyltransferase  28.95 
 
 
161 aa  44.7  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2410  acetyltransferase, GNAT family  28.95 
 
 
165 aa  44.7  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0733  GCN5-related N-acetyltransferase  28.99 
 
 
169 aa  44.3  0.0005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.881941  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3289  GCN5-related N-acetyltransferase  28.99 
 
 
170 aa  44.3  0.0005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.827106  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0877  acetyltransferase  30.2 
 
 
169 aa  44.3  0.0005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3125  GCN5-related N-acetyltransferase  29.2 
 
 
180 aa  44.3  0.0006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.018265  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0491  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  27.38 
 
 
148 aa  43.9  0.0008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0856  GCN5-related N-acetyltransferase  31.07 
 
 
166 aa  43.5  0.0009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0597402 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1578  acetyltransferase  34.18 
 
 
139 aa  43.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.157598  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2117  GCN5-related N-acetyltransferase  41.54 
 
 
187 aa  43.5  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0852  GCN5-related N-acetyltransferase  29.77 
 
 
168 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.623177  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5497  GCN5-related N-acetyltransferase  35.14 
 
 
712 aa  42.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0755902  normal  0.0749364 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4090  GCN5-related N-acetyltransferase  30.97 
 
 
162 aa  42.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0578  GCN5-related N-acetyltransferase  25.34 
 
 
157 aa  42.4  0.002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0887  GCN5-related N-acetyltransferase  29.55 
 
 
173 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0061391  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0358  GCN5-related N-acetyltransferase  29.5 
 
 
149 aa  42  0.003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0083  acetyltransferase  27.69 
 
 
150 aa  42  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.108179  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1184  GCN5-related N-acetyltransferase  35.94 
 
 
180 aa  41.6  0.004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00161881  hitchhiker  0.00363544 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0460  putative acetyltransferase  34.78 
 
 
157 aa  41.2  0.004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0957  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  30.49 
 
 
176 aa  41.6  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3401  GCN5-related N-acetyltransferase  31.87 
 
 
170 aa  41.2  0.005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1700  GCN5-related N-acetyltransferase  36.76 
 
 
184 aa  40.8  0.006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000000469355  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3030  GCN5-related N-acetyltransferase  43.4 
 
 
174 aa  40.8  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.25589  hitchhiker  0.00490416 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0493  acetyltransferase  30.97 
 
 
171 aa  40.8  0.006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0133  acetyltransferase  33.33 
 
 
144 aa  41.2  0.006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.738255  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2569  acetyltransferase  29.93 
 
 
282 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000118025  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2037  GCN5-related N-acetyltransferase  32.65 
 
 
168 aa  40.8  0.007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.200151 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4410  GCN5-related N-acetyltransferase  31.86 
 
 
162 aa  40.8  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3001  GCN5-related N-acetyltransferase  28.47 
 
 
159 aa  40.4  0.008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4607  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  28.42 
 
 
148 aa  40  0.009  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000779076  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1667  acetyltransferase, GNAT family  32.58 
 
 
155 aa  40.4  0.009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04214  hypothetical protein  28.42 
 
 
148 aa  40  0.009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.31912  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5885  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  28.42 
 
 
148 aa  40  0.009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.276325  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1492  GCN5-related N-acetyltransferase  38.6 
 
 
172 aa  40  0.009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4920  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  28.42 
 
 
148 aa  40  0.009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0578007  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3684  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  28.42 
 
 
148 aa  40  0.009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.895597  hitchhiker  0.000147746 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4968  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  28.42 
 
 
148 aa  40  0.009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00012833  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04248  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  28.42 
 
 
148 aa  40  0.009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.258576  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1597  acetyltransferase  32.58 
 
 
155 aa  40.4  0.009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1453  acetyltransferase  32.58 
 
 
155 aa  40.4  0.009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1480  acetyltransferase  32.58 
 
 
155 aa  40.4  0.009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3626  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  28.42 
 
 
148 aa  40  0.009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0500841  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0875  GCN5-related N-acetyltransferase  28.79 
 
 
169 aa  40  0.01  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.183729  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>