18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_0856 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003910  CPS_0856  M16 family metallopeptidase  100 
 
 
577 aa  1187    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2248  peptidase M16 domain-containing protein  28.03 
 
 
647 aa  185  2.0000000000000003e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.082562  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_09434  zinc metalloprotease, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G07610)  25.89 
 
 
1057 aa  56.2  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.169282 
 
 
-
 
NC_006686  CND04540  cytoplasm protein, putative  27.22 
 
 
1054 aa  49.7  0.0001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0121322  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08061  Zn-dependent peptidase  24.47 
 
 
414 aa  48.1  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0754  Zn-dependent peptidase-like  24.21 
 
 
421 aa  48.1  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08071  Zn-dependent peptidase  24.85 
 
 
416 aa  48.1  0.0005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.786648  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3286  peptidase M16 domain protein  26 
 
 
913 aa  47.4  0.0007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2190  peptidase M16 domain protein  25.74 
 
 
879 aa  47.4  0.0008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1179  peptidase M16C associated  23.6 
 
 
987 aa  46.6  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0156529 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2620  peptidase M16 domain-containing protein  24.72 
 
 
422 aa  46.6  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0136175  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1070  peptidase M16 domain protein  25.85 
 
 
878 aa  46.6  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1312  peptidase M16 domain protein  25 
 
 
840 aa  45.8  0.002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.307141 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1395  peptidase, putative  24.6 
 
 
973 aa  45.4  0.003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.131852  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1656  putative peptidase  24.6 
 
 
973 aa  45.1  0.004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0884161  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1237  peptidase M16 domain-containing protein  32.53 
 
 
419 aa  44.7  0.005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_84931  predicted protein  22.87 
 
 
1049 aa  43.5  0.01  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0611  peptidase M16 domain protein  22.16 
 
 
473 aa  43.5  0.01  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>