126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_0635 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_0635  arginine N-succinyltransferase  100 
 
 		 338 aa  703    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0650  arginine N-succinyltransferase  64.88 
 
 		 344 aa  468  1.0000000000000001e-131  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.202921  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3192  arginine N-succinyltransferase  57.69 
 
 		 339 aa  426  1e-118  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0337373  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0656  arginine N-succinyltransferase  58.88 
 
 		 339 aa  424  1e-118  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.868394  hitchhiker  0.0000048698 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00498  arginine N-succinyltransferase  63.2 
 
 		 345 aa  423  1e-117  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0579  arginine N-succinyltransferase  57.99 
 
 		 339 aa  421  1e-116  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.934676 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0810  arginine N-succinyltransferase  57.4 
 
 		 339 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00028495 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3515  arginine N-succinyltransferase  57.27 
 
 		 339 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002276  arginine N-succinyltransferase  59.64 
 
 		 339 aa  412  1e-114  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3298  arginine N-succinyltransferase  56.21 
 
 		 339 aa  410  1e-113  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3010  arginine N-succinyltransferase  55.62 
 
 		 339 aa  409  1e-113  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2194  putative arginine/ornithine succinyltransferase  59.47 
 
 		 339 aa  410  1e-113  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00078  arginine N-succinyltransferase  59.94 
 
 		 339 aa  409  1e-113  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3696  arginine N-succinyltransferase  55.92 
 
 		 339 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0572  arginine N-succinyltransferase  55.92 
 
 		 339 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0646  arginine N-succinyltransferase  55.92 
 
 		 339 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3753  arginine N-succinyltransferase  55.62 
 
 		 339 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3879  arginine N-succinyltransferase  55.92 
 
 		 339 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0618  arginine N-succinyltransferase  55.92 
 
 		 339 aa  404  1e-111  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0612  arginine succinyltransferase  55.62 
 
 		 339 aa  404  1e-111  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3418  arginine succinyltransferase  55.62 
 
 		 339 aa  403  1e-111  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0994163 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0611  arginine succinyltransferase  55.62 
 
 		 339 aa  404  1e-111  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0978523 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0164  arginine N-succinyltransferase  54.94 
 
 		 346 aa  398  9.999999999999999e-111  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.468749  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2734  arginine N-succinyltransferase  58.75 
 
 		 339 aa  393  1e-108  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1055  arginine N-succinyltransferase  53.96 
 
 		 347 aa  390  1e-107  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1627  arginine N-succinyltransferase  52.05 
 
 		 348 aa  377  1e-103  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.299273 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3669  arginine N-succinyltransferase  49.71 
 
 		 350 aa  340  2e-92  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.386578  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1969  arginine succinyltransferase  47.77 
 
 		 344 aa  335  5e-91  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01716  arginine succinyltransferase  47.77 
 
 		 344 aa  334  1e-90  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1895  arginine N-succinyltransferase  47.77 
 
 		 344 aa  334  1e-90  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.564615  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2465  arginine succinyltransferase  47.77 
 
 		 344 aa  334  1e-90  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01704  hypothetical protein  47.77 
 
 		 344 aa  334  1e-90  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1830  arginine succinyltransferase  47.77 
 
 		 344 aa  334  1e-90  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2843  arginine succinyltransferase  48.97 
 
 		 344 aa  334  1e-90  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.836294  hitchhiker  0.00555507 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1885  arginine succinyltransferase  47.77 
 
 		 344 aa  334  1e-90  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0106586 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1444  arginine succinyltransferase  47.77 
 
 		 344 aa  334  1e-90  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.606563 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1431  arginine succinyltransferase  48.07 
 
 		 344 aa  332  5e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.899315  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1416  arginine succinyltransferase  48.07 
 
 		 344 aa  332  5e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2042  arginine succinyltransferase  48.07 
 
 		 344 aa  332  5e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0825718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1869  arginine succinyltransferase  48.07 
 
 		 344 aa  332  5e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1399  arginine succinyltransferase  48.07 
 
 		 344 aa  332  5e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.121302 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1994  arginine succinyltransferase  47.18 
 
 		 344 aa  332  6e-90  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2228  arginine succinyltransferase  47.83 
 
 		 350 aa  329  5.0000000000000004e-89  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52690  arginine/ornithine succinyltransferase AII subunit  50.6 
 
 		 340 aa  328  6e-89  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.433336  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2519  arginine succinyltransferase  47.83 
 
 		 350 aa  328  1.0000000000000001e-88  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2909  arginine succinyltransferase  49.55 
 
 		 338 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.633986 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4283  arginine succinyltransferase  49.85 
 
 		 341 aa  326  3e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.795056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1697  arginine succinyltransferase  46.47 
 
 		 344 aa  324  1e-87  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2120  arginine succinyltransferase  47.95 
 
 		 349 aa  324  1e-87  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4618  arginine/ornithine succinyltransferase AII subunit  49.7 
 
 		 340 aa  323  2e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.311562  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0485  arginine succinyltransferase  46.47 
 
 		 344 aa  320  1.9999999999999998e-86  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.468224  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3563  arginine N-succinyltransferase  48.81 
 
 		 341 aa  318  7.999999999999999e-86  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.179201  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1834  arginine N-succinyltransferase, beta subunit  48.81 
 
 		 341 aa  318  9e-86  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.860406  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34480  arginine N-succinyltransferase  47.34 
 
 		 345 aa  309  4e-83  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3768  arginine N-succinyltransferase  49.41 
 
 		 342 aa  309  4e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.243261  normal  0.0192708 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3317  arginine N-succinyltransferase  44.87 
 
 		 361 aa  306  3e-82  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3984  arginine N-succinyltransferase  48.53 
 
 		 342 aa  302  7.000000000000001e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1436  arginine N-succinyltransferase  48.24 
 
 		 342 aa  300  3e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4479  arginine N-succinyltransferase, beta subunit  48.24 
 
 		 342 aa  299  4e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.198516  normal  0.241866 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1665  arginine N-succinyltransferase, beta chain  45.7 
 
 		 347 aa  296  3e-79  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1671  arginine N-succinyltransferase, beta chain  45.83 
 
 		 346 aa  295  6e-79  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1777  arginine N-succinyltransferase beta subunit  42.48 
 
 		 343 aa  290  2e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1063  arginine N-succinyltransferase  42.15 
 
 		 348 aa  290  2e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2122  arginine N-succinyltransferase  41.57 
 
 		 348 aa  288  7e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.653543  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2845  arginine N-succinyltransferase beta subunit  42.48 
 
 		 343 aa  288  9e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1063  arginine N-succinyltransferase  41.69 
 
 		 347 aa  288  1e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0114093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2725  arginine N-succinyltransferase, beta subunit  42.48 
 
 		 343 aa  287  2e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0703  arginine N-succinyltransferase  42.18 
 
 		 343 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.891122  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1182  arginine N-succinyltransferase  42.18 
 
 		 343 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.187182  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2783  arginine N-succinyltransferase, beta subunit  42.48 
 
 		 343 aa  286  4e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.472941  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1159  arginine N-succinyltransferase  41.89 
 
 		 343 aa  286  5e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.26404  normal  0.0654026 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2921  arginine succinyltransferase  42.23 
 
 		 343 aa  285  9e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.651402  normal  0.342556 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0593  arginine N-succinyltransferase, beta chain  42.18 
 
 		 343 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2423  arginine N-succinyltransferase, beta subunit  42.18 
 
 		 343 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.441325  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2868  arginine N-succinyltransferase, beta subunit  42.18 
 
 		 343 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1734  arginine N-succinyltransferase, beta subunit  42.18 
 
 		 343 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.559674  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2806  arginine succinyltransferase  42.23 
 
 		 338 aa  280  2e-74  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4293  arginine succinyltransferase  41.59 
 
 		 343 aa  278  9e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.920553 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1560  arginine N-succinyltransferase  40.7 
 
 		 346 aa  276  3e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.551289  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2053  arginine succinyltransferase  43.75 
 
 		 344 aa  276  4e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1785  arginine N-succinyltransferase  41.59 
 
 		 341 aa  271  1e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3668  arginine N-succinyltransferase  40.71 
 
 		 337 aa  270  2e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0458765  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2890  arginine N-succinyltransferase  40.29 
 
 		 366 aa  266  4e-70  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.210367  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4480  arginine N-succinyltransferase, alpha subunit  40.12 
 
 		 339 aa  266  5e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.98058  normal  0.247147 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1435  arginine N-succinyltransferase  39.82 
 
 		 339 aa  265  8.999999999999999e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.888596  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3985  arginine/ornithine succinyltransferase, alpha subunit  39.82 
 
 		 339 aa  264  2e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3564  arginine N-succinyltransferase  40.23 
 
 		 343 aa  262  6e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0659293  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1833  arginine N-succinyltransferase, alpha subunit  39.65 
 
 		 343 aa  262  6.999999999999999e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.882626  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52700  arginine/ornithine succinyltransferase AI subunit  39.35 
 
 		 338 aa  262  8e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.6133  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4619  arginine/ornithine succinyltransferase AI subunit  39.35 
 
 		 338 aa  262  8e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.30321  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3769  arginine/ornithine succinyltransferase, alpha subunit  38.64 
 
 		 339 aa  259  4e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0115 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2910  arginine succinyltransferase  39.94 
 
 		 338 aa  251  1e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.500754 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2054  arginine succinyltransferase  38.46 
 
 		 338 aa  250  2e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34490  arginine N-succinyltransferase  36.98 
 
 		 338 aa  249  7e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0883  arginine succinyltransferase  37.5 
 
 		 345 aa  246  4.9999999999999997e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.174815  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4284  arginine succinyltransferase  38.64 
 
 		 339 aa  243  3e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.584908  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2202  arginine/ornithine succinyltransferase subunit  37.01 
 
 		 334 aa  243  3.9999999999999997e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.276454 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1940  arginine N-succinyltransferase  39.26 
 
 		 330 aa  233  5e-60  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3318  arginine N-succinyltransferase  36.61 
 
 		 338 aa  225  6e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2807  arginine succinyltransferase  35.42 
 
 		 354 aa  224  2e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>