12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_0685 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008262  CPR_0685  ISCpe5, transposase  100 
 
 		 119 aa  229  7.000000000000001e-60  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0187  ISCpe5, transposase  91.6 
 
 		 521 aa  208  2e-53  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0485  ISCpe5, transposase  91.6 
 
 		 521 aa  208  2e-53  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0165022  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1439  transposase IS4 family protein  42.98 
 
 		 535 aa  84.7  3e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2397  transposase ISNCY family protein  42.11 
 
 		 534 aa  73.9  0.0000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000732775  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1154  transposase IS4 family protein  43.08 
 
 		 486 aa  61.6  0.000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.543034  normal  0.461467 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2458  IS4 family transposase  43.48 
 
 		 517 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000853603  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0758  ISCpe5, transposase  92.59 
 
 		 154 aa  50.1  0.00001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000330282  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0767  ISCpe5, transposase  92.59 
 
 		 222 aa  50.1  0.00001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0429535  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0677  transposase  44.44 
 
 		 130 aa  45.1  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0350  transposase, IS4 family protein  33.9 
 
 		 536 aa  43.1  0.001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1000  transposase, IS4 family protein  33.9 
 
 		 536 aa  43.1  0.001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.309848  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>