61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_2106 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_2106  S4 domain-containing protein  100 
 
 		 253 aa  510  1e-144  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00816123  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1820  S4 domain-containing protein  99.6 
 
 		 253 aa  508  1e-143  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000243371  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1087  RNA-binding S4 domain protein  41.15 
 
 		 255 aa  168  6e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1318  RNA-binding S4 domain protein  31.08 
 
 		 265 aa  120  1.9999999999999998e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.210837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1264  RNA-binding S4 domain protein  32.81 
 
 		 245 aa  120  1.9999999999999998e-26  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0715  RNA-binding S4 domain-containing protein  32.6 
 
 		 255 aa  119  3e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.369549  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1889  RNA-binding S4 domain-containing protein  36.63 
 
 		 248 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000373186  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3250  photosystem II S4 domain protein  30.38 
 
 		 259 aa  110  3e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2846  photosystem II S4 domain protein  30.38 
 
 		 259 aa  110  3e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4774  photosystem II S4 domain protein  29.18 
 
 		 259 aa  106  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.789019 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0789  RNA-binding S4  33.33 
 
 		 263 aa  105  6e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000446217  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1012  RNA-binding S4  29.74 
 
 		 259 aa  105  8e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00865709 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1503  RNA-binding S4  29.02 
 
 		 259 aa  104  2e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.2704  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1086  RNA-binding S4 domain protein  30.84 
 
 		 267 aa  101  1e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000000637661  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0599  RNA-binding S4 domain protein  32.82 
 
 		 260 aa  100  2e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000013354  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5081  photosystem II S4 domain-containing protein  29.31 
 
 		 259 aa  100  3e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.673535  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2360  RNA-binding S4 domain-containing protein  29.92 
 
 		 263 aa  97.8  1e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000894269  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1347  RNA-binding S4 domain protein  29.41 
 
 		 260 aa  95.5  7e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000348222  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4044  RNA-binding S4 domain protein  30.61 
 
 		 265 aa  94.4  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000223229  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4198  RNA-binding S4  27.54 
 
 		 259 aa  91.7  1e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41009  predicted protein  27.64 
 
 		 303 aa  90.9  2e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.106009  normal  0.55194 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3998  S4 domain protein  28.78 
 
 		 241 aa  90.9  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000894164  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3724  RNA-binding S4 domain-containing protein  29.21 
 
 		 255 aa  90.9  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0195579  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1243  S4 domain protein  28.78 
 
 		 255 aa  90.1  3e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000893019  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3949  S4 domain protein  28.78 
 
 		 255 aa  90.1  3e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000108737  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3639  S4 domain-containing protein  28.78 
 
 		 255 aa  90.1  3e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000680133  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3656  S4 domain-containing protein  29.83 
 
 		 255 aa  89.7  4e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2321  photosystem II S4 domain protein  28.38 
 
 		 259 aa  89.4  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3942  S4 domain-containing protein  28.78 
 
 		 255 aa  89.4  6e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.131052  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3911  S4 domain protein  29.28 
 
 		 255 aa  89  7e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000445845 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3748  S4 domain-containing protein  29.83 
 
 		 255 aa  87.8  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.125171  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4036  s4 domain-containing protein  29.83 
 
 		 255 aa  87.8  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00128697  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09250  RNA-binding S4 domain protein  26.24 
 
 		 262 aa  87  3e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0028436  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2546  RNA-binding S4 domain-containing protein  26.83 
 
 		 257 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0803565  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1037  RNA-binding S4 domain protein  27.75 
 
 		 257 aa  84.7  0.000000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000298489  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1140  cell division protein  26.7 
 
 		 256 aa  84  0.000000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1907  RNA-binding S4 domain protein  27.44 
 
 		 257 aa  82.8  0.000000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0483  ylmH protein  26.29 
 
 		 262 aa  82.4  0.000000000000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1198  cell division protein  28.51 
 
 		 265 aa  81.3  0.00000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0781  cell division protein  26.27 
 
 		 266 aa  79.7  0.00000000000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0824201  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1296  hypothetical protein  27.5 
 
 		 255 aa  79.3  0.00000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0920  RNA-binding S4 domain protein  35.48 
 
 		 255 aa  77.4  0.0000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000818747  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0756  ylmH protein  26.47 
 
 		 220 aa  75.9  0.0000000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.031626  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0596  RNA-binding S4 domain-containing protein  24 
 
 		 261 aa  73.2  0.000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000430784  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1250  RNA-binding S4 domain-containing protein  26.13 
 
 		 268 aa  72.4  0.000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000129333  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1275  RNA-binding S4 domain-containing protein  26.13 
 
 		 268 aa  72.4  0.000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000253973  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1489  cell division protein  30.53 
 
 		 265 aa  66.6  0.0000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2058  cell division protein  26.59 
 
 		 263 aa  65.1  0.000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14111  hypothetical protein  25.98 
 
 		 262 aa  64.3  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.531857  normal  0.068656 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17841  S4-like domain-containing protein  27.54 
 
 		 262 aa  60.5  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.348814  normal  0.852292 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0928  RNA-binding S4  28.71 
 
 		 262 aa  58.9  0.00000008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.618898  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2152  RNA-binding S4  25.77 
 
 		 258 aa  57.4  0.0000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.224826  normal  0.370435 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0877  RNA-binding S4 domain protein  24.79 
 
 		 231 aa  55.5  0.0000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.702037 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05221  S4-like domain-containing protein  22.17 
 
 		 295 aa  55.1  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15571  S4-like domain-containing protein  28.14 
 
 		 263 aa  51.6  0.00001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0525  RNA-binding S4  23.85 
 
 		 261 aa  51.6  0.00001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15421  S4-like domain-containing protein  27.54 
 
 		 263 aa  49.7  0.00005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0340616  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1454  RNA-binding S4  27.54 
 
 		 263 aa  48.1  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15171  S4-like domain-containing protein  26.46 
 
 		 263 aa  45.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2761  RNA-binding S4 domain-containing protein  22.16 
 
 		 227 aa  45.4  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2020  RNA-binding S4  20.98 
 
 		 262 aa  42  0.008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>