20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_1724 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_1724  hypothetical protein  100 
 
 
184 aa  349  1e-95  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0569422  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1452  hypothetical protein  93.48 
 
 
184 aa  330  8e-90  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00758898  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5306  hypothetical protein  52.17 
 
 
186 aa  164  5e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5702  hypothetical protein  52.17 
 
 
186 aa  164  5e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5148  hypothetical protein  51.63 
 
 
186 aa  164  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0726043  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5547  hypothetical protein  52.17 
 
 
186 aa  164  9e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000423726 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5133  hypothetical protein  50 
 
 
186 aa  162  3e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000775312  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5638  hypothetical protein  49.73 
 
 
186 aa  162  3e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5576  hypothetical protein  49.73 
 
 
186 aa  162  3e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5591  hypothetical protein  49.73 
 
 
186 aa  161  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.999364  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5246  hypothetical protein  49.46 
 
 
186 aa  159  2e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5371  hypothetical protein  48.09 
 
 
186 aa  158  3e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.414011  hitchhiker  0.000233389 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0574  hypothetical protein  37.3 
 
 
196 aa  104  8e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1353  hypothetical protein  46.6 
 
 
212 aa  96.7  2e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.723305  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1942  hypothetical protein  35.56 
 
 
181 aa  61.2  0.000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.318368  normal  0.0759806 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1318  hypothetical protein  38.55 
 
 
149 aa  59.7  0.00000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3211  hypothetical protein  31.52 
 
 
198 aa  59.7  0.00000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000281051  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0941  BS_ykrK family protein  29.35 
 
 
158 aa  49.7  0.00002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.253763  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0278  hypothetical protein  28.47 
 
 
199 aa  45.1  0.0006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00110569  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0269  hypothetical protein  27.07 
 
 
199 aa  43.9  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000581001  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>