59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_0527 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_0527  S-adenosylmethionine decarboxylase  100 
 
 		 271 aa  552  1e-156  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0513  S-adenosylmethionine decarboxylase  99.26 
 
 		 271 aa  546  1e-154  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2796  S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme  64.93 
 
 		 270 aa  372  1e-102  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2244  S-adenosylmethionine decarboxylase  58.71 
 
 		 273 aa  334  1e-90  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.868188  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0913  S-adenosylmethionine decarboxylase  62.55 
 
 		 264 aa  330  1e-89  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.365148  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3552  S-adenosylmethionine decarboxylase  60.3 
 
 		 263 aa  328  6e-89  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46080  S-adenosylmethionine decarboxylase  56.93 
 
 		 264 aa  325  5e-88  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0795  S-adenosylmethionine decarboxylase  58.05 
 
 		 264 aa  324  1e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08390  S-adenosylmethionine decarboxylase  58.05 
 
 		 264 aa  324  1e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000233299 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1749  S-adenosylmethionine decarboxylase  57.89 
 
 		 279 aa  320  9.999999999999999e-87  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.163697  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5109  S-adenosylmethionine decarboxylase  56.18 
 
 		 264 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.720307 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4575  S-adenosylmethionine decarboxylase  55.81 
 
 		 264 aa  319  3e-86  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2078  S-adenosylmethionine decarboxylase  57.14 
 
 		 292 aa  317  1e-85  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1235  S-adenosylmethionine decarboxylase  58.36 
 
 		 276 aa  316  2e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000212775  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0598  S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme  56.18 
 
 		 264 aa  316  3e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0668  S-adenosylmethionine decarboxylase  57.74 
 
 		 264 aa  314  8e-85  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000040658  normal  0.405798 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2355  S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme  57.14 
 
 		 269 aa  314  9.999999999999999e-85  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0951  S-adenosylmethionine decarboxylase  57.95 
 
 		 276 aa  313  1.9999999999999998e-84  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1015  S-adenosylmethionine decarboxylase  58.11 
 
 		 264 aa  312  2.9999999999999996e-84  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4002  S-adenosylmethionine decarboxylase  59.09 
 
 		 264 aa  312  2.9999999999999996e-84  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0197  S-adenosylmethionine decarboxylase  56.98 
 
 		 264 aa  310  2e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.940693  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0184  S-adenosylmethionine decarboxylase  56.98 
 
 		 264 aa  310  2e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.877989 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0189  S-adenosylmethionine decarboxylase  56.98 
 
 		 264 aa  310  2e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.409769  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0181  S-adenosylmethionine decarboxylase  56.98 
 
 		 264 aa  310  2e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.515006  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0180  S-adenosylmethionine decarboxylase  56.6 
 
 		 264 aa  309  4e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3482  S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme  56.23 
 
 		 264 aa  308  9e-83  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000023207  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0127  S-adenosylmethionine decarboxylase  56.23 
 
 		 264 aa  308  9e-83  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000000736728  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00118  hypothetical protein  56.23 
 
 		 264 aa  308  9e-83  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000726106  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0113  S-adenosylmethionine decarboxylase  56.23 
 
 		 264 aa  308  9e-83  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000197451  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0130  S-adenosylmethionine decarboxylase  56.23 
 
 		 264 aa  308  9e-83  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.274606  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3539  S-adenosylmethionine decarboxylase  56.23 
 
 		 264 aa  308  9e-83  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00206954  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00119  S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme  56.23 
 
 		 264 aa  308  9e-83  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00015961  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0124  S-adenosylmethionine decarboxylase  56.23 
 
 		 264 aa  308  9e-83  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000121988  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0122  S-adenosylmethionine decarboxylase  56.23 
 
 		 264 aa  308  9e-83  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0933555  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3714  S-adenosylmethionine decarboxylase  55.3 
 
 		 264 aa  307  1.0000000000000001e-82  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.17268  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2837  S-adenosylmethionine decarboxylase  57.36 
 
 		 264 aa  306  2.0000000000000002e-82  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04007  S-adenosylmethionine decarboxylase  55.3 
 
 		 264 aa  306  2.0000000000000002e-82  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3483  S-adenosylmethionine decarboxylase  56.82 
 
 		 264 aa  304  9.000000000000001e-82  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000055229  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3355  S-adenosylmethionine decarboxylase  56.82 
 
 		 264 aa  304  9.000000000000001e-82  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000217345  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1024  S-adenosylmethionine decarboxylase  56.82 
 
 		 264 aa  304  9.000000000000001e-82  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3130  S-adenosylmethionine decarboxylase  57.58 
 
 		 264 aa  304  1.0000000000000001e-81  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0878  S-adenosylmethionine decarboxylase  54.92 
 
 		 264 aa  302  3.0000000000000004e-81  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00026083  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0791  S-adenosylmethionine decarboxylase  54.92 
 
 		 264 aa  301  6.000000000000001e-81  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0737  S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme  54.96 
 
 		 276 aa  298  5e-80  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000135532  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2794  S-adenosylmethionine decarboxylase  52.83 
 
 		 271 aa  296  3e-79  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0123327  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0630  S-adenosylmethionine decarboxylase  44.15 
 
 		 252 aa  220  1.9999999999999999e-56  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5626  S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme  29.31 
 
 		 123 aa  48.9  0.00008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000593222 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5302  S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme  27.42 
 
 		 123 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000919231 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4906  S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme  26.92 
 
 		 123 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5446  S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme  26.92 
 
 		 123 aa  48.1  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5333  S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme  28.45 
 
 		 123 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4891  S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme  26.98 
 
 		 123 aa  47.4  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5061  S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme  26.92 
 
 		 123 aa  48.1  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5378  S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme  27.42 
 
 		 123 aa  46.6  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1085  S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme  25.37 
 
 		 129 aa  46.2  0.0006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000176984  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3365  S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme  25 
 
 		 125 aa  45.1  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000484703  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1388  S-adenosylmethionine decarboxylase related  25 
 
 		 168 aa  45.4  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0715  S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme  25.76 
 
 		 124 aa  43.1  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000012378  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2122  S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme  24.81 
 
 		 124 aa  42.4  0.009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000043873  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>