18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNB00570 on replicon NC_006684
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006684  CNB00570  histone H3, putative  100 
 
 
138 aa  275  1e-73  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.17026  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02540  DNA binding protein, putative  94.2 
 
 
138 aa  260  4e-69  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_17380  predicted protein  89.86 
 
 
136 aa  248  3e-65  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00249476 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38934  predicted protein  89.86 
 
 
136 aa  248  3e-65  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0906859 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_32891  predicted protein  89.13 
 
 
136 aa  246  6e-65  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.418665  normal 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_50872  histone H3 isoform 1b  88.41 
 
 
136 aa  244  2e-64  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_11841  histone H3 isoform 1a  88.41 
 
 
136 aa  244  2e-64  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_50695  histone H3 isoform 1c  88.41 
 
 
136 aa  244  2e-64  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_21239  H3.3  88.41 
 
 
136 aa  244  4e-64  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_69601  predicted protein  88.41 
 
 
136 aa  241  1.9999999999999999e-63  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0806469  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00733  Histone H3 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P23753]  87.68 
 
 
136 aa  241  1.9999999999999999e-63  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.013922  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_90527  predicted protein  87.68 
 
 
136 aa  241  3e-63  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_73330  predicted protein  87.68 
 
 
136 aa  241  3e-63  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.136215  normal  0.357299 
 
 
-
 
NC_006670  CNA00540  hypothetical protein  64.96 
 
 
152 aa  169  9e-42  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.288962  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54259  predicted protein  72.92 
 
 
171 aa  146  1.0000000000000001e-34  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06554  hypothetical protein similar to histone H3 (Broad)  68.69 
 
 
191 aa  143  8.000000000000001e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29021  predicted protein  58.87 
 
 
135 aa  138  1.9999999999999998e-32  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0364167  n/a   
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_16843  predicted protein  65.66 
 
 
104 aa  134  5e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>