40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_2246 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_2246  hypothetical protein  100 
 
 		 343 aa  722    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.761361  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39460  hypothetical protein  35.42 
 
 		 379 aa  199  7e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000677129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3352  hypothetical protein  34.52 
 
 		 379 aa  194  2e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0531  hypothetical protein  33.71 
 
 		 401 aa  184  1.0000000000000001e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1213  hypothetical protein  35.61 
 
 		 355 aa  183  3e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.329567 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2166  hypothetical protein  33.13 
 
 		 401 aa  182  8.000000000000001e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0255897  hitchhiker  0.00875673 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1669  hypothetical protein  32.04 
 
 		 388 aa  159  5e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000198868  normal  0.0260977 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7585  Catalase  27.46 
 
 		 358 aa  145  9e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0318  catalase  28.25 
 
 		 370 aa  144  3e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2662  hypothetical protein  30.15 
 
 		 366 aa  142  7e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1220  hypothetical protein  28.9 
 
 		 364 aa  138  1e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6096  catalase  27.93 
 
 		 358 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0903  catalase  28.97 
 
 		 359 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.822977  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2562  catalase  28.66 
 
 		 359 aa  130  5.0000000000000004e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.181116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0795  hypothetical protein  28.8 
 
 		 364 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.113105  normal  0.0287536 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0829  hypothetical protein  28.39 
 
 		 364 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.322007  normal  0.274333 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0319  catalase  28.85 
 
 		 360 aa  126  6e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0869  hypothetical protein  29.06 
 
 		 364 aa  125  1e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0789444 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1393  hypothetical protein  27.95 
 
 		 363 aa  124  2e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.21911  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3086  catalase  26.97 
 
 		 364 aa  124  2e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3994  hypothetical protein  27.25 
 
 		 362 aa  123  4e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.368177  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4430  hypothetical protein  26.37 
 
 		 384 aa  123  6e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0122102 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4800  hypothetical protein  26.72 
 
 		 358 aa  122  7e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.502429  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1687  hypothetical protein  28.97 
 
 		 362 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.716667 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5311  catalase  28.02 
 
 		 381 aa  120  3.9999999999999996e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.240071 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0738  hypothetical protein  28.29 
 
 		 455 aa  119  6e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3256  catalase  24.86 
 
 		 356 aa  119  6e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0658316 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3406  catalase  26.21 
 
 		 364 aa  119  7e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6095  catalase  28.86 
 
 		 360 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3760  catalase  26.92 
 
 		 362 aa  118  9.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3180  hypothetical protein  27.78 
 
 		 362 aa  116  6e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4064  hypothetical protein  26.76 
 
 		 388 aa  114  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.428606  normal  0.405565 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1217  hypothetical protein  27.38 
 
 		 383 aa  113  4.0000000000000004e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.149824 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4816  hypothetical protein  27.97 
 
 		 457 aa  113  5e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0826  hypothetical protein  28.87 
 
 		 337 aa  112  7.000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2051  hypothetical protein  25.92 
 
 		 383 aa  110  5e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4741  peroxidase  23.79 
 
 		 355 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.198593  normal  0.744523 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0854  catalase-like  24.34 
 
 		 331 aa  49.7  0.00008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0128  Catalase  32.18 
 
 		 517 aa  43.9  0.004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3078  catalase  32.18 
 
 		 499 aa  43.5  0.005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>