17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_1555 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_1555  hypothetical protein  100 
 
 
190 aa  385  1e-106  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.247042  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2899  hypothetical protein  63.16 
 
 
199 aa  251  5.000000000000001e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.503548 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0475  hypothetical protein  61.38 
 
 
195 aa  245  3e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.33606  normal  0.699739 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4023  hypothetical protein  56.61 
 
 
192 aa  231  6e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0523  hypothetical protein  58.82 
 
 
189 aa  226  2e-58  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0933  hypothetical protein  57.89 
 
 
191 aa  219  1.9999999999999999e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.96578  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02070  hypothetical protein  54.21 
 
 
190 aa  213  1.9999999999999998e-54  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.273031  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2172  hypothetical protein  52.75 
 
 
190 aa  196  1.0000000000000001e-49  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0649  hypothetical protein  47.51 
 
 
194 aa  188  4e-47  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.229996 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2653  hypothetical protein  34.74 
 
 
197 aa  142  3e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.649476  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1548  hypothetical protein  39.57 
 
 
190 aa  134  9e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0780  hypothetical protein  37.02 
 
 
193 aa  126  2.0000000000000002e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.247882  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1206  hypothetical protein  38.67 
 
 
192 aa  124  1e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.736669  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1441  hypothetical protein  36.46 
 
 
183 aa  119  1.9999999999999998e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.46496  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0928  hypothetical protein  38.12 
 
 
190 aa  117  9.999999999999999e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1115  hypothetical protein  34.21 
 
 
190 aa  112  3e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1177  hypothetical protein  36.46 
 
 
183 aa  112  5e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.518058 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>