18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_1318 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_1318  hypothetical protein  100 
 
 
337 aa  702    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.889926  normal  0.0248237 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3074  hypothetical protein  37.28 
 
 
374 aa  192  8e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.53561  normal  0.340992 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0600  hypothetical protein  33.81 
 
 
371 aa  165  9e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.976562 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1330  hypothetical protein  34.74 
 
 
378 aa  153  5e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0907  hypothetical protein  31.66 
 
 
371 aa  149  8e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0733644  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1707  DNA repair and recombination protein RadA  31.82 
 
 
348 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0838  hypothetical protein  32.57 
 
 
427 aa  138  1e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.23349  normal  0.0364981 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1705  hypothetical protein  33.12 
 
 
303 aa  129  8.000000000000001e-29  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1706  HAD superfamily hydrolase  30.82 
 
 
303 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1386  hypothetical protein  31.83 
 
 
343 aa  123  4e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000644457  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2915  hypothetical protein  29.07 
 
 
377 aa  108  9.000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.709933  normal  0.0301279 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2655  hypothetical protein  30.45 
 
 
378 aa  103  4e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4146  hypothetical protein  30.11 
 
 
387 aa  103  5e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.142076  normal  0.649349 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0594  hypothetical protein  26.06 
 
 
332 aa  102  7e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4009  hypothetical protein  28.7 
 
 
406 aa  101  2e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.281652  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0041  hypothetical protein  26.69 
 
 
344 aa  97.4  3e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1489  hypothetical protein  27.34 
 
 
422 aa  94  3e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.627679 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0703  hypothetical protein  35.56 
 
 
381 aa  76.6  0.0000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>