42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_1490 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009714  CHAB381_1490  50S ribosomal protein L32  100 
 
 		 48 aa  98.6  2e-20  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.334451  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0235  50S ribosomal protein L32  87.5 
 
 		 48 aa  89.7  1e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0988  50S ribosomal protein L32  85.42 
 
 		 48 aa  89  2e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0227  ribosomal protein L32  83.33 
 
 		 50 aa  88.6  3e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0375  50S ribosomal protein L32  83.33 
 
 		 48 aa  84.7  3e-16  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1628  50S ribosomal protein L32  85.42 
 
 		 48 aa  85.5  3e-16  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.901218  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0352  50S ribosomal protein L32  83.33 
 
 		 48 aa  84.7  3e-16  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1336  50S ribosomal protein L32  81.25 
 
 		 48 aa  84.7  4e-16  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1773  50S ribosomal protein L32  75 
 
 		 49 aa  77.4  0.00000000000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0718  50S ribosomal protein L32  53.06 
 
 		 57 aa  52.4  0.000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000204019  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1209  50S ribosomal protein L32  53.06 
 
 		 57 aa  52.4  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000286453  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1187  50S ribosomal protein L32  53.06 
 
 		 57 aa  52.4  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000373536  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0633  ribosomal protein L32  47.92 
 
 		 63 aa  49.7  0.00001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1878  50S ribosomal protein L32  51.02 
 
 		 58 aa  48.9  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2467  ribosomal protein L32  45.83 
 
 		 61 aa  48.5  0.00003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000135728  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1340  ribosomal protein L32  51.02 
 
 		 58 aa  47.4  0.00006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.5028  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1006  50S ribosomal protein L32  48.98 
 
 		 57 aa  44.7  0.0004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2573  50S ribosomal protein L32  51.02 
 
 		 57 aa  44.7  0.0005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000210481  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3682  50S ribosomal protein L32  51.02 
 
 		 57 aa  44.7  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000568057  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3665  50S ribosomal protein L32  51.02 
 
 		 57 aa  44.7  0.0005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.37288e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3774  50S ribosomal protein L32  51.02 
 
 		 57 aa  44.7  0.0005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000267221  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3750  50S ribosomal protein L32  51.02 
 
 		 57 aa  44.7  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000162679  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3969  50S ribosomal protein L32  51.02 
 
 		 57 aa  44.7  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00129021  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3938  50S ribosomal protein L32  51.02 
 
 		 57 aa  44.7  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1217  50S ribosomal protein L32  51.02 
 
 		 57 aa  44.7  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000020176  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4062  50S ribosomal protein L32  51.02 
 
 		 57 aa  44.7  0.0005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000151561  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3976  50S ribosomal protein L32  51.02 
 
 		 57 aa  44.7  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000000135237  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4024  50S ribosomal protein L32  51.02 
 
 		 57 aa  44.7  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000551113  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2140  50S ribosomal protein L32  48.98 
 
 		 61 aa  43.5  0.001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1411  50S ribosomal protein L32P  40.82 
 
 		 60 aa  42.7  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.361798  hitchhiker  0.00000964737 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3774  50S ribosomal protein L32  46.94 
 
 		 62 aa  41.6  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3664  50S ribosomal protein L32  46.94 
 
 		 62 aa  41.6  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.416645  normal  0.271996 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5277  50S ribosomal protein L32  46.94 
 
 		 61 aa  41.6  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.5638  normal  0.0541919 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5920  50S ribosomal protein L32  46.94 
 
 		 61 aa  41.6  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5115  50S ribosomal protein L32  46.94 
 
 		 62 aa  41.6  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.637 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3466  50S ribosomal protein L32  46.94 
 
 		 62 aa  41.6  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.357647  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1412  ribosomal protein L32  35.42 
 
 		 62 aa  40.8  0.006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3111  50S ribosomal protein L32  44.9 
 
 		 61 aa  40.4  0.008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0825  50S ribosomal protein L32  40.82 
 
 		 58 aa  40.4  0.009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000369841  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0497  50S ribosomal protein L32  42.86 
 
 		 61 aa  40  0.01  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0625  50S ribosomal protein L32  42.86 
 
 		 61 aa  40  0.01  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.19517  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0122  50S ribosomal protein L32  44.9 
 
 		 61 aa  40  0.01  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>