47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_1144 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008599  CFF8240_1144  CvpA family protein  100 
 
 		 191 aa  372  1e-102  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.111431  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0223  CvpA family protein  52.94 
 
 		 206 aa  186  2e-46  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.903437  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0999  CvpA family protein  56.38 
 
 		 205 aa  174  9e-43  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000386189  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0486  conserved hypothetical integral membrane protein, CvpA family  47.03 
 
 		 189 aa  169  2e-41  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1558  cvpA family protein  46.32 
 
 		 190 aa  160  1e-38  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.383217  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0422  cvpA family protein  45.55 
 
 		 187 aa  159  2e-38  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00865734  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0448  cvpA family protein  44.5 
 
 		 187 aa  156  2e-37  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.179388  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1644  CvpA family protein  41.36 
 
 		 218 aa  154  7e-37  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0578  Colicin V production protein  42.71 
 
 		 184 aa  149  3e-35  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.637194  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1271  colicin V production protein  46.5 
 
 		 216 aa  112  3e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2162  colicin V production protein  24.1 
 
 		 193 aa  73.2  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.340208  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2461  colicin V production protein  27.33 
 
 		 165 aa  56.6  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.400499  normal  0.228634 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3564  colicin V production protein  33.94 
 
 		 164 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4403  colicin V production protein  33.94 
 
 		 164 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.454399  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3964  colicin V production protein  33.94 
 
 		 164 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2119  colicin V production protein  33.03 
 
 		 164 aa  54.3  0.0000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.73318  normal  0.0950051 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3354  colicin V production protein  33.33 
 
 		 164 aa  53.9  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0663199  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3859  colicin V production protein  33.33 
 
 		 164 aa  53.9  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4616  colicin V production protein  27.4 
 
 		 164 aa  53.5  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.186008  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1329  Colicin V production protein  27.97 
 
 		 192 aa  53.5  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0804105  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1102  colicin V production protein  32.41 
 
 		 165 aa  52.8  0.000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.374563 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2401  colicin V production protein  25.13 
 
 		 234 aa  52.4  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4093  colicin V production protein  26.74 
 
 		 189 aa  50.4  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.799722  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3077  Colicin V production protein  29.22 
 
 		 158 aa  50.1  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.770622 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1283  colicin V production protein  32.86 
 
 		 165 aa  48.1  0.00008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.797864  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2875  putative bacteriocin production related protein  26.88 
 
 		 164 aa  48.1  0.00008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2065  CvpA family protein  31.25 
 
 		 165 aa  47.4  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1723  Colicin V production protein  31.25 
 
 		 165 aa  47.4  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.558498  normal  0.0591031 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1266  colicin V production protein  20.81 
 
 		 198 aa  47  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.488094  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2996  colicin V production protein  26.56 
 
 		 210 aa  46.6  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.581672 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1298  hypothetical protein  28.17 
 
 		 177 aa  46.2  0.0003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0771  colicin V production protein  29.13 
 
 		 182 aa  46.2  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1297  hypothetical protein  28.17 
 
 		 177 aa  46.2  0.0003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1872  colicin V production protein  26.49 
 
 		 159 aa  45.8  0.0004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.356571  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2453  colicin V production protein  23.53 
 
 		 208 aa  45.8  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.921002 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2681  CvpA family protein  28.93 
 
 		 166 aa  45.1  0.0006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4380  colicin V production protein  28.04 
 
 		 164 aa  44.3  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.452488  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3500  Colicin V production protein  22.34 
 
 		 211 aa  44.3  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3940  colicin V production protein  26.8 
 
 		 203 aa  43.1  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2454  colicin V production family protein  26.12 
 
 		 155 aa  42.7  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0552  Colicin V production protein  31.03 
 
 		 162 aa  42.7  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0935  colicin V production protein  24.61 
 
 		 183 aa  42  0.005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0780  colicin V production protein  26.09 
 
 		 173 aa  42  0.006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1553  colicin V production protein  27.43 
 
 		 189 aa  41.2  0.008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0745627  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2301  CvpA family protein  29.81 
 
 		 164 aa  41.2  0.01  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0685  CvpA family protein  29.81 
 
 		 164 aa  41.2  0.01  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.345398  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0763  CvpA family protein  29.81 
 
 		 164 aa  41.2  0.01  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>